Protein–RNA interactions for Protein: A6NGC4

TLCD2, TLC domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLCD2A6NGC4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TLCD2A6NGC4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TLCD2A6NGC4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TLCD2A6NGC4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TLCD2A6NGC4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TLCD2A6NGC4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TLCD2A6NGC4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TLCD2A6NGC4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TLCD2A6NGC4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TLCD2A6NGC4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TLCD2A6NGC4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TLCD2A6NGC4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TLCD2A6NGC4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TLCD2A6NGC4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLCD2A6NGC4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLCD2A6NGC4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLCD2A6NGC4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLCD2A6NGC4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TLCD2A6NGC4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TLCD2A6NGC4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TLCD2A6NGC4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TLCD2A6NGC4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TLCD2A6NGC4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TLCD2A6NGC4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TLCD2A6NGC4 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TLCD2A6NGC4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TLCD2A6NGC4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TLCD2A6NGC4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TLCD2A6NGC4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TLCD2A6NGC4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TLCD2A6NGC4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TLCD2A6NGC4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TLCD2A6NGC4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TLCD2A6NGC4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TLCD2A6NGC4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TLCD2A6NGC4 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TLCD2A6NGC4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TLCD2A6NGC4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TLCD2A6NGC4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TLCD2A6NGC4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TLCD2A6NGC4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TLCD2A6NGC4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TLCD2A6NGC4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TLCD2A6NGC4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TLCD2A6NGC4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TLCD2A6NGC4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TLCD2A6NGC4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLCD2A6NGC4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLCD2A6NGC4 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TLCD2A6NGC4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLCD2A6NGC4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLCD2A6NGC4 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLCD2A6NGC4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLCD2A6NGC4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLCD2A6NGC4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TLCD2A6NGC4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLCD2A6NGC4 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLCD2A6NGC4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TLCD2A6NGC4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLCD2A6NGC4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLCD2A6NGC4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLCD2A6NGC4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLCD2A6NGC4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLCD2A6NGC4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TLCD2A6NGC4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLCD2A6NGC4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLCD2A6NGC4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLCD2A6NGC4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLCD2A6NGC4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TLCD2A6NGC4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLCD2A6NGC4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLCD2A6NGC4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLCD2A6NGC4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TLCD2A6NGC4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLCD2A6NGC4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TLCD2A6NGC4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLCD2A6NGC4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLCD2A6NGC4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLCD2A6NGC4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLCD2A6NGC4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TLCD2A6NGC4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TLCD2A6NGC4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TLCD2A6NGC4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TLCD2A6NGC4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TLCD2A6NGC4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TLCD2A6NGC4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TLCD2A6NGC4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TLCD2A6NGC4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TLCD2A6NGC4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TLCD2A6NGC4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TLCD2A6NGC4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TLCD2A6NGC4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TLCD2A6NGC4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TLCD2A6NGC4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLCD2A6NGC4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLCD2A6NGC4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLCD2A6NGC4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLCD2A6NGC4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLCD2A6NGC4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TLCD2A6NGC4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms