Protein–RNA interactions for Protein: A6NFR6

C5orf60, Putative uncharacterized protein C5orf60, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf60A6NFR6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
C5orf60A6NFR6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C5orf60A6NFR6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
C5orf60A6NFR6 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C5orf60A6NFR6 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C5orf60A6NFR6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C5orf60A6NFR6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C5orf60A6NFR6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
C5orf60A6NFR6 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
C5orf60A6NFR6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C5orf60A6NFR6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C5orf60A6NFR6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C5orf60A6NFR6 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
C5orf60A6NFR6 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
C5orf60A6NFR6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C5orf60A6NFR6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
C5orf60A6NFR6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C5orf60A6NFR6 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
C5orf60A6NFR6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C5orf60A6NFR6 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C5orf60A6NFR6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C5orf60A6NFR6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C5orf60A6NFR6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C5orf60A6NFR6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
C5orf60A6NFR6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
C5orf60A6NFR6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C5orf60A6NFR6 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C5orf60A6NFR6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C5orf60A6NFR6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C5orf60A6NFR6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C5orf60A6NFR6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
C5orf60A6NFR6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
C5orf60A6NFR6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C5orf60A6NFR6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C5orf60A6NFR6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
C5orf60A6NFR6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
C5orf60A6NFR6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
C5orf60A6NFR6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C5orf60A6NFR6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C5orf60A6NFR6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C5orf60A6NFR6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C5orf60A6NFR6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C5orf60A6NFR6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C5orf60A6NFR6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C5orf60A6NFR6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C5orf60A6NFR6 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C5orf60A6NFR6 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C5orf60A6NFR6 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C5orf60A6NFR6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C5orf60A6NFR6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C5orf60A6NFR6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C5orf60A6NFR6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C5orf60A6NFR6 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C5orf60A6NFR6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C5orf60A6NFR6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C5orf60A6NFR6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
C5orf60A6NFR6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C5orf60A6NFR6 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C5orf60A6NFR6 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C5orf60A6NFR6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C5orf60A6NFR6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
C5orf60A6NFR6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C5orf60A6NFR6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C5orf60A6NFR6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C5orf60A6NFR6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
C5orf60A6NFR6 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C5orf60A6NFR6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
C5orf60A6NFR6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C5orf60A6NFR6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C5orf60A6NFR6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C5orf60A6NFR6 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C5orf60A6NFR6 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C5orf60A6NFR6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C5orf60A6NFR6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C5orf60A6NFR6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C5orf60A6NFR6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C5orf60A6NFR6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C5orf60A6NFR6 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C5orf60A6NFR6 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C5orf60A6NFR6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C5orf60A6NFR6 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
C5orf60A6NFR6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C5orf60A6NFR6 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C5orf60A6NFR6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C5orf60A6NFR6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
C5orf60A6NFR6 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C5orf60A6NFR6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C5orf60A6NFR6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C5orf60A6NFR6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C5orf60A6NFR6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
C5orf60A6NFR6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
C5orf60A6NFR6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C5orf60A6NFR6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C5orf60A6NFR6 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C5orf60A6NFR6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C5orf60A6NFR6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C5orf60A6NFR6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
C5orf60A6NFR6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C5orf60A6NFR6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C5orf60A6NFR6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms