Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5N1

HRH3, Histamine H3 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRH3Q9Y5N1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HRH3Q9Y5N1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HRH3Q9Y5N1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HRH3Q9Y5N1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HRH3Q9Y5N1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HRH3Q9Y5N1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HRH3Q9Y5N1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HRH3Q9Y5N1 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HRH3Q9Y5N1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HRH3Q9Y5N1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HRH3Q9Y5N1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HRH3Q9Y5N1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HRH3Q9Y5N1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HRH3Q9Y5N1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HRH3Q9Y5N1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HRH3Q9Y5N1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HRH3Q9Y5N1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HRH3Q9Y5N1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HRH3Q9Y5N1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HRH3Q9Y5N1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HRH3Q9Y5N1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HRH3Q9Y5N1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HRH3Q9Y5N1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HRH3Q9Y5N1 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HRH3Q9Y5N1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HRH3Q9Y5N1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HRH3Q9Y5N1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HRH3Q9Y5N1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HRH3Q9Y5N1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HRH3Q9Y5N1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HRH3Q9Y5N1 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HRH3Q9Y5N1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HRH3Q9Y5N1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HRH3Q9Y5N1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HRH3Q9Y5N1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HRH3Q9Y5N1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HRH3Q9Y5N1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HRH3Q9Y5N1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HRH3Q9Y5N1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HRH3Q9Y5N1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HRH3Q9Y5N1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HRH3Q9Y5N1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HRH3Q9Y5N1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HRH3Q9Y5N1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HRH3Q9Y5N1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HRH3Q9Y5N1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HRH3Q9Y5N1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HRH3Q9Y5N1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HRH3Q9Y5N1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HRH3Q9Y5N1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HRH3Q9Y5N1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HRH3Q9Y5N1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HRH3Q9Y5N1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HRH3Q9Y5N1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HRH3Q9Y5N1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HRH3Q9Y5N1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HRH3Q9Y5N1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HRH3Q9Y5N1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HRH3Q9Y5N1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HRH3Q9Y5N1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HRH3Q9Y5N1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HRH3Q9Y5N1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HRH3Q9Y5N1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HRH3Q9Y5N1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HRH3Q9Y5N1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HRH3Q9Y5N1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HRH3Q9Y5N1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HRH3Q9Y5N1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HRH3Q9Y5N1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HRH3Q9Y5N1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
HRH3Q9Y5N1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HRH3Q9Y5N1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HRH3Q9Y5N1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HRH3Q9Y5N1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HRH3Q9Y5N1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
HRH3Q9Y5N1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
HRH3Q9Y5N1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
HRH3Q9Y5N1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRH3Q9Y5N1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
HRH3Q9Y5N1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRH3Q9Y5N1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRH3Q9Y5N1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRH3Q9Y5N1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRH3Q9Y5N1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
HRH3Q9Y5N1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HRH3Q9Y5N1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HRH3Q9Y5N1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HRH3Q9Y5N1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HRH3Q9Y5N1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
HRH3Q9Y5N1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HRH3Q9Y5N1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
HRH3Q9Y5N1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
HRH3Q9Y5N1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
HRH3Q9Y5N1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HRH3Q9Y5N1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HRH3Q9Y5N1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HRH3Q9Y5N1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
HRH3Q9Y5N1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HRH3Q9Y5N1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
HRH3Q9Y5N1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.6 ms