Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y597

KCTD3, BTB/POZ domain-containing protein KCTD3, humanhuman

Predictions only

Length 815 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD3Q9Y597 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
KCTD3Q9Y597 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCTD3Q9Y597 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCTD3Q9Y597 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCTD3Q9Y597 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCTD3Q9Y597 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCTD3Q9Y597 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
KCTD3Q9Y597 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCTD3Q9Y597 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCTD3Q9Y597 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCTD3Q9Y597 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
KCTD3Q9Y597 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCTD3Q9Y597 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCTD3Q9Y597 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCTD3Q9Y597 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCTD3Q9Y597 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KCTD3Q9Y597 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCTD3Q9Y597 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCTD3Q9Y597 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCTD3Q9Y597 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCTD3Q9Y597 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KCTD3Q9Y597 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCTD3Q9Y597 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCTD3Q9Y597 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCTD3Q9Y597 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCTD3Q9Y597 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCTD3Q9Y597 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCTD3Q9Y597 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KCTD3Q9Y597 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCTD3Q9Y597 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCTD3Q9Y597 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCTD3Q9Y597 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCTD3Q9Y597 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KCTD3Q9Y597 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KCTD3Q9Y597 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCTD3Q9Y597 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCTD3Q9Y597 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCTD3Q9Y597 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
KCTD3Q9Y597 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCTD3Q9Y597 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KCTD3Q9Y597 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCTD3Q9Y597 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KCTD3Q9Y597 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCTD3Q9Y597 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCTD3Q9Y597 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KCTD3Q9Y597 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
KCTD3Q9Y597 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCTD3Q9Y597 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KCTD3Q9Y597 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
KCTD3Q9Y597 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCTD3Q9Y597 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KCTD3Q9Y597 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCTD3Q9Y597 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCTD3Q9Y597 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCTD3Q9Y597 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCTD3Q9Y597 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCTD3Q9Y597 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCTD3Q9Y597 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCTD3Q9Y597 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KCTD3Q9Y597 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCTD3Q9Y597 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCTD3Q9Y597 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCTD3Q9Y597 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCTD3Q9Y597 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KCTD3Q9Y597 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCTD3Q9Y597 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCTD3Q9Y597 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCTD3Q9Y597 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCTD3Q9Y597 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCTD3Q9Y597 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCTD3Q9Y597 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCTD3Q9Y597 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCTD3Q9Y597 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCTD3Q9Y597 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCTD3Q9Y597 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCTD3Q9Y597 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCTD3Q9Y597 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCTD3Q9Y597 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KCTD3Q9Y597 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCTD3Q9Y597 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCTD3Q9Y597 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCTD3Q9Y597 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KCTD3Q9Y597 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCTD3Q9Y597 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCTD3Q9Y597 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCTD3Q9Y597 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCTD3Q9Y597 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KCTD3Q9Y597 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KCTD3Q9Y597 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCTD3Q9Y597 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCTD3Q9Y597 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCTD3Q9Y597 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCTD3Q9Y597 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCTD3Q9Y597 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KCTD3Q9Y597 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCTD3Q9Y597 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KCTD3Q9Y597 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
KCTD3Q9Y597 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115 ms