Protein–RNA interactions for Protein: Q9UN75

PCDHA12, Protocadherin alpha-12, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHA12Q9UN75 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHA12Q9UN75 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHA12Q9UN75 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHA12Q9UN75 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHA12Q9UN75 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHA12Q9UN75 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHA12Q9UN75 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHA12Q9UN75 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHA12Q9UN75 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHA12Q9UN75 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHA12Q9UN75 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHA12Q9UN75 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHA12Q9UN75 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCDHA12Q9UN75 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
PCDHA12Q9UN75 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PCDHA12Q9UN75 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PCDHA12Q9UN75 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCDHA12Q9UN75 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCDHA12Q9UN75 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCDHA12Q9UN75 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHA12Q9UN75 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHA12Q9UN75 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHA12Q9UN75 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHA12Q9UN75 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHA12Q9UN75 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHA12Q9UN75 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHA12Q9UN75 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHA12Q9UN75 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCDHA12Q9UN75 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCDHA12Q9UN75 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCDHA12Q9UN75 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCDHA12Q9UN75 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCDHA12Q9UN75 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHA12Q9UN75 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHA12Q9UN75 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHA12Q9UN75 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHA12Q9UN75 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHA12Q9UN75 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHA12Q9UN75 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHA12Q9UN75 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHA12Q9UN75 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHA12Q9UN75 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCDHA12Q9UN75 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCDHA12Q9UN75 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCDHA12Q9UN75 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCDHA12Q9UN75 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCDHA12Q9UN75 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCDHA12Q9UN75 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCDHA12Q9UN75 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCDHA12Q9UN75 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCDHA12Q9UN75 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PCDHA12Q9UN75 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PCDHA12Q9UN75 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
PCDHA12Q9UN75 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PCDHA12Q9UN75 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHA12Q9UN75 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDHA12Q9UN75 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHA12Q9UN75 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHA12Q9UN75 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHA12Q9UN75 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHA12Q9UN75 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHA12Q9UN75 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHA12Q9UN75 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHA12Q9UN75 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHA12Q9UN75 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHA12Q9UN75 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHA12Q9UN75 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHA12Q9UN75 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHA12Q9UN75 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHA12Q9UN75 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHA12Q9UN75 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHA12Q9UN75 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHA12Q9UN75 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHA12Q9UN75 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHA12Q9UN75 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHA12Q9UN75 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHA12Q9UN75 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHA12Q9UN75 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PCDHA12Q9UN75 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PCDHA12Q9UN75 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PCDHA12Q9UN75 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PCDHA12Q9UN75 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
PCDHA12Q9UN75 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHA12Q9UN75 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PCDHA12Q9UN75 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHA12Q9UN75 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHA12Q9UN75 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PCDHA12Q9UN75 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDHA12Q9UN75 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDHA12Q9UN75 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDHA12Q9UN75 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDHA12Q9UN75 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PCDHA12Q9UN75 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDHA12Q9UN75 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDHA12Q9UN75 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PCDHA12Q9UN75 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PCDHA12Q9UN75 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PCDHA12Q9UN75 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDHA12Q9UN75 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PCDHA12Q9UN75 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms