Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CTNNA3Q9UI47 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CTNNA3Q9UI47 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CTNNA3Q9UI47 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CTNNA3Q9UI47 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CTNNA3Q9UI47 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CTNNA3Q9UI47 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
CTNNA3Q9UI47 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CTNNA3Q9UI47 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CTNNA3Q9UI47 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CTNNA3Q9UI47 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CTNNA3Q9UI47 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CTNNA3Q9UI47 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CTNNA3Q9UI47 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CTNNA3Q9UI47 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CTNNA3Q9UI47 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CTNNA3Q9UI47 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CTNNA3Q9UI47 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CTNNA3Q9UI47 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CTNNA3Q9UI47 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
CTNNA3Q9UI47 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CTNNA3Q9UI47 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CTNNA3Q9UI47 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CTNNA3Q9UI47 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CTNNA3Q9UI47 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CTNNA3Q9UI47 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CTNNA3Q9UI47 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CTNNA3Q9UI47 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CTNNA3Q9UI47 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CTNNA3Q9UI47 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CTNNA3Q9UI47 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CTNNA3Q9UI47 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CTNNA3Q9UI47 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CTNNA3Q9UI47 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CTNNA3Q9UI47 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
CTNNA3Q9UI47 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
CTNNA3Q9UI47 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CTNNA3Q9UI47 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CTNNA3Q9UI47 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
CTNNA3Q9UI47 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CTNNA3Q9UI47 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CTNNA3Q9UI47 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CTNNA3Q9UI47 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
CTNNA3Q9UI47 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CTNNA3Q9UI47 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CTNNA3Q9UI47 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
CTNNA3Q9UI47 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CTNNA3Q9UI47 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
CTNNA3Q9UI47 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CTNNA3Q9UI47 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CTNNA3Q9UI47 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
CTNNA3Q9UI47 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CTNNA3Q9UI47 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CTNNA3Q9UI47 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CTNNA3Q9UI47 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
CTNNA3Q9UI47 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
CTNNA3Q9UI47 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
CTNNA3Q9UI47 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CTNNA3Q9UI47 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CTNNA3Q9UI47 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CTNNA3Q9UI47 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
CTNNA3Q9UI47 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
CTNNA3Q9UI47 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CTNNA3Q9UI47 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
CTNNA3Q9UI47 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CTNNA3Q9UI47 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
CTNNA3Q9UI47 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CTNNA3Q9UI47 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CTNNA3Q9UI47 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CTNNA3Q9UI47 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
CTNNA3Q9UI47 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
CTNNA3Q9UI47 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
CTNNA3Q9UI47 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.41■■■□□ 2.3
CTNNA3Q9UI47 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
CTNNA3Q9UI47 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CTNNA3Q9UI47 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CTNNA3Q9UI47 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CTNNA3Q9UI47 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
CTNNA3Q9UI47 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
CTNNA3Q9UI47 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
CTNNA3Q9UI47 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CTNNA3Q9UI47 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
CTNNA3Q9UI47 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
CTNNA3Q9UI47 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CTNNA3Q9UI47 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
CTNNA3Q9UI47 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CTNNA3Q9UI47 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CTNNA3Q9UI47 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CTNNA3Q9UI47 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
CTNNA3Q9UI47 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CTNNA3Q9UI47 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CTNNA3Q9UI47 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
CTNNA3Q9UI47 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CTNNA3Q9UI47 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
CTNNA3Q9UI47 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CTNNA3Q9UI47 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CTNNA3Q9UI47 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
CTNNA3Q9UI47 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CTNNA3Q9UI47 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
CTNNA3Q9UI47 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms