Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VTI1BQ9UEU0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
VTI1BQ9UEU0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
VTI1BQ9UEU0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VTI1BQ9UEU0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VTI1BQ9UEU0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VTI1BQ9UEU0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
VTI1BQ9UEU0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
VTI1BQ9UEU0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
VTI1BQ9UEU0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VTI1BQ9UEU0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
VTI1BQ9UEU0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
VTI1BQ9UEU0 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VTI1BQ9UEU0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
VTI1BQ9UEU0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
VTI1BQ9UEU0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
VTI1BQ9UEU0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VTI1BQ9UEU0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VTI1BQ9UEU0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
VTI1BQ9UEU0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
VTI1BQ9UEU0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
VTI1BQ9UEU0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
VTI1BQ9UEU0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VTI1BQ9UEU0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
VTI1BQ9UEU0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VTI1BQ9UEU0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VTI1BQ9UEU0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VTI1BQ9UEU0 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
VTI1BQ9UEU0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
VTI1BQ9UEU0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VTI1BQ9UEU0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
VTI1BQ9UEU0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VTI1BQ9UEU0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VTI1BQ9UEU0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
VTI1BQ9UEU0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
VTI1BQ9UEU0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
VTI1BQ9UEU0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VTI1BQ9UEU0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
VTI1BQ9UEU0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VTI1BQ9UEU0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
VTI1BQ9UEU0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VTI1BQ9UEU0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VTI1BQ9UEU0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VTI1BQ9UEU0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VTI1BQ9UEU0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
VTI1BQ9UEU0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VTI1BQ9UEU0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
VTI1BQ9UEU0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
VTI1BQ9UEU0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VTI1BQ9UEU0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
VTI1BQ9UEU0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VTI1BQ9UEU0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VTI1BQ9UEU0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
VTI1BQ9UEU0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VTI1BQ9UEU0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VTI1BQ9UEU0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VTI1BQ9UEU0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
VTI1BQ9UEU0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VTI1BQ9UEU0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VTI1BQ9UEU0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VTI1BQ9UEU0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
VTI1BQ9UEU0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
VTI1BQ9UEU0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
VTI1BQ9UEU0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VTI1BQ9UEU0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VTI1BQ9UEU0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VTI1BQ9UEU0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
VTI1BQ9UEU0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
VTI1BQ9UEU0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VTI1BQ9UEU0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
VTI1BQ9UEU0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VTI1BQ9UEU0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VTI1BQ9UEU0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
VTI1BQ9UEU0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VTI1BQ9UEU0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
VTI1BQ9UEU0 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VTI1BQ9UEU0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VTI1BQ9UEU0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VTI1BQ9UEU0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VTI1BQ9UEU0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VTI1BQ9UEU0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
VTI1BQ9UEU0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
VTI1BQ9UEU0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VTI1BQ9UEU0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VTI1BQ9UEU0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VTI1BQ9UEU0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
VTI1BQ9UEU0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VTI1BQ9UEU0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
VTI1BQ9UEU0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VTI1BQ9UEU0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VTI1BQ9UEU0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VTI1BQ9UEU0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
VTI1BQ9UEU0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
VTI1BQ9UEU0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
VTI1BQ9UEU0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
VTI1BQ9UEU0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
VTI1BQ9UEU0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
VTI1BQ9UEU0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VTI1BQ9UEU0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
VTI1BQ9UEU0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84 ms