Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COPG2Q9UBF2 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
COPG2Q9UBF2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COPG2Q9UBF2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
COPG2Q9UBF2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
COPG2Q9UBF2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPG2Q9UBF2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPG2Q9UBF2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPG2Q9UBF2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPG2Q9UBF2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
COPG2Q9UBF2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPG2Q9UBF2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPG2Q9UBF2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPG2Q9UBF2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPG2Q9UBF2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
COPG2Q9UBF2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COPG2Q9UBF2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COPG2Q9UBF2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COPG2Q9UBF2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COPG2Q9UBF2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COPG2Q9UBF2 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
COPG2Q9UBF2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
COPG2Q9UBF2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
COPG2Q9UBF2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
COPG2Q9UBF2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPG2Q9UBF2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPG2Q9UBF2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPG2Q9UBF2 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPG2Q9UBF2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPG2Q9UBF2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
COPG2Q9UBF2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COPG2Q9UBF2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
COPG2Q9UBF2 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
COPG2Q9UBF2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
COPG2Q9UBF2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
COPG2Q9UBF2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
COPG2Q9UBF2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPG2Q9UBF2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPG2Q9UBF2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPG2Q9UBF2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPG2Q9UBF2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
COPG2Q9UBF2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COPG2Q9UBF2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COPG2Q9UBF2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
COPG2Q9UBF2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COPG2Q9UBF2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
COPG2Q9UBF2 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPG2Q9UBF2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
COPG2Q9UBF2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPG2Q9UBF2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPG2Q9UBF2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
COPG2Q9UBF2 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
COPG2Q9UBF2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
COPG2Q9UBF2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COPG2Q9UBF2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COPG2Q9UBF2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COPG2Q9UBF2 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COPG2Q9UBF2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COPG2Q9UBF2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COPG2Q9UBF2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
COPG2Q9UBF2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COPG2Q9UBF2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
COPG2Q9UBF2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COPG2Q9UBF2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
COPG2Q9UBF2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COPG2Q9UBF2 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COPG2Q9UBF2 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
COPG2Q9UBF2 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COPG2Q9UBF2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
COPG2Q9UBF2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COPG2Q9UBF2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
COPG2Q9UBF2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COPG2Q9UBF2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COPG2Q9UBF2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COPG2Q9UBF2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
COPG2Q9UBF2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPG2Q9UBF2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPG2Q9UBF2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
COPG2Q9UBF2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPG2Q9UBF2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPG2Q9UBF2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPG2Q9UBF2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPG2Q9UBF2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
COPG2Q9UBF2 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COPG2Q9UBF2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COPG2Q9UBF2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
COPG2Q9UBF2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
COPG2Q9UBF2 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COPG2Q9UBF2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COPG2Q9UBF2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COPG2Q9UBF2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
COPG2Q9UBF2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
COPG2Q9UBF2 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COPG2Q9UBF2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COPG2Q9UBF2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
COPG2Q9UBF2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COPG2Q9UBF2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
COPG2Q9UBF2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COPG2Q9UBF2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
COPG2Q9UBF2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms