Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB4

ATXN10, Ataxin-10, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN10Q9UBB4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATXN10Q9UBB4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATXN10Q9UBB4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATXN10Q9UBB4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATXN10Q9UBB4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATXN10Q9UBB4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATXN10Q9UBB4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATXN10Q9UBB4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATXN10Q9UBB4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATXN10Q9UBB4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATXN10Q9UBB4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATXN10Q9UBB4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATXN10Q9UBB4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATXN10Q9UBB4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATXN10Q9UBB4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATXN10Q9UBB4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATXN10Q9UBB4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ATXN10Q9UBB4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATXN10Q9UBB4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATXN10Q9UBB4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATXN10Q9UBB4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ATXN10Q9UBB4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATXN10Q9UBB4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATXN10Q9UBB4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATXN10Q9UBB4 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATXN10Q9UBB4 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATXN10Q9UBB4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATXN10Q9UBB4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATXN10Q9UBB4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATXN10Q9UBB4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ATXN10Q9UBB4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATXN10Q9UBB4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATXN10Q9UBB4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATXN10Q9UBB4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATXN10Q9UBB4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATXN10Q9UBB4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATXN10Q9UBB4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATXN10Q9UBB4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATXN10Q9UBB4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATXN10Q9UBB4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATXN10Q9UBB4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATXN10Q9UBB4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATXN10Q9UBB4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATXN10Q9UBB4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATXN10Q9UBB4 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATXN10Q9UBB4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ATXN10Q9UBB4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATXN10Q9UBB4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATXN10Q9UBB4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATXN10Q9UBB4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATXN10Q9UBB4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATXN10Q9UBB4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATXN10Q9UBB4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATXN10Q9UBB4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATXN10Q9UBB4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATXN10Q9UBB4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATXN10Q9UBB4 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATXN10Q9UBB4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATXN10Q9UBB4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATXN10Q9UBB4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ATXN10Q9UBB4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATXN10Q9UBB4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATXN10Q9UBB4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATXN10Q9UBB4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATXN10Q9UBB4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATXN10Q9UBB4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATXN10Q9UBB4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATXN10Q9UBB4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATXN10Q9UBB4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATXN10Q9UBB4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATXN10Q9UBB4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATXN10Q9UBB4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
ATXN10Q9UBB4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATXN10Q9UBB4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATXN10Q9UBB4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ATXN10Q9UBB4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATXN10Q9UBB4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATXN10Q9UBB4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATXN10Q9UBB4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATXN10Q9UBB4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATXN10Q9UBB4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATXN10Q9UBB4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATXN10Q9UBB4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATXN10Q9UBB4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATXN10Q9UBB4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATXN10Q9UBB4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATXN10Q9UBB4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ATXN10Q9UBB4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATXN10Q9UBB4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATXN10Q9UBB4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ATXN10Q9UBB4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ATXN10Q9UBB4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATXN10Q9UBB4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ATXN10Q9UBB4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATXN10Q9UBB4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATXN10Q9UBB4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ATXN10Q9UBB4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATXN10Q9UBB4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATXN10Q9UBB4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATXN10Q9UBB4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms