Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0W5

SCHIP1, Schwannomin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCHIP1Q9P0W5 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCHIP1Q9P0W5 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
SCHIP1Q9P0W5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SCHIP1Q9P0W5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCHIP1Q9P0W5 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SCHIP1Q9P0W5 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SCHIP1Q9P0W5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SCHIP1Q9P0W5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SCHIP1Q9P0W5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCHIP1Q9P0W5 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCHIP1Q9P0W5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCHIP1Q9P0W5 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SCHIP1Q9P0W5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SCHIP1Q9P0W5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCHIP1Q9P0W5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCHIP1Q9P0W5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCHIP1Q9P0W5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCHIP1Q9P0W5 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCHIP1Q9P0W5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCHIP1Q9P0W5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCHIP1Q9P0W5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCHIP1Q9P0W5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SCHIP1Q9P0W5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCHIP1Q9P0W5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCHIP1Q9P0W5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCHIP1Q9P0W5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCHIP1Q9P0W5 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCHIP1Q9P0W5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SCHIP1Q9P0W5 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCHIP1Q9P0W5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCHIP1Q9P0W5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCHIP1Q9P0W5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCHIP1Q9P0W5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCHIP1Q9P0W5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCHIP1Q9P0W5 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCHIP1Q9P0W5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCHIP1Q9P0W5 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCHIP1Q9P0W5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCHIP1Q9P0W5 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCHIP1Q9P0W5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCHIP1Q9P0W5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCHIP1Q9P0W5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCHIP1Q9P0W5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCHIP1Q9P0W5 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SCHIP1Q9P0W5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCHIP1Q9P0W5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCHIP1Q9P0W5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCHIP1Q9P0W5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCHIP1Q9P0W5 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SCHIP1Q9P0W5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCHIP1Q9P0W5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCHIP1Q9P0W5 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCHIP1Q9P0W5 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCHIP1Q9P0W5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCHIP1Q9P0W5 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCHIP1Q9P0W5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCHIP1Q9P0W5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCHIP1Q9P0W5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCHIP1Q9P0W5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCHIP1Q9P0W5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SCHIP1Q9P0W5 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCHIP1Q9P0W5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCHIP1Q9P0W5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCHIP1Q9P0W5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCHIP1Q9P0W5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCHIP1Q9P0W5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCHIP1Q9P0W5 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCHIP1Q9P0W5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCHIP1Q9P0W5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCHIP1Q9P0W5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCHIP1Q9P0W5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCHIP1Q9P0W5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCHIP1Q9P0W5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCHIP1Q9P0W5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCHIP1Q9P0W5 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCHIP1Q9P0W5 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCHIP1Q9P0W5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCHIP1Q9P0W5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCHIP1Q9P0W5 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCHIP1Q9P0W5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCHIP1Q9P0W5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCHIP1Q9P0W5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCHIP1Q9P0W5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCHIP1Q9P0W5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCHIP1Q9P0W5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCHIP1Q9P0W5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCHIP1Q9P0W5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SCHIP1Q9P0W5 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SCHIP1Q9P0W5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCHIP1Q9P0W5 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCHIP1Q9P0W5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCHIP1Q9P0W5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCHIP1Q9P0W5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCHIP1Q9P0W5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCHIP1Q9P0W5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCHIP1Q9P0W5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCHIP1Q9P0W5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCHIP1Q9P0W5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCHIP1Q9P0W5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCHIP1Q9P0W5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms