Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZU0

FLRT3, Leucine-rich repeat transmembrane protein FLRT3, humanhuman

Predictions only

Length 649 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLRT3Q9NZU0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FLRT3Q9NZU0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FLRT3Q9NZU0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FLRT3Q9NZU0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FLRT3Q9NZU0 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FLRT3Q9NZU0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FLRT3Q9NZU0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FLRT3Q9NZU0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FLRT3Q9NZU0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FLRT3Q9NZU0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FLRT3Q9NZU0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FLRT3Q9NZU0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FLRT3Q9NZU0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FLRT3Q9NZU0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FLRT3Q9NZU0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FLRT3Q9NZU0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
FLRT3Q9NZU0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FLRT3Q9NZU0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FLRT3Q9NZU0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FLRT3Q9NZU0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FLRT3Q9NZU0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FLRT3Q9NZU0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FLRT3Q9NZU0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
FLRT3Q9NZU0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FLRT3Q9NZU0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FLRT3Q9NZU0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
FLRT3Q9NZU0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FLRT3Q9NZU0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FLRT3Q9NZU0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
FLRT3Q9NZU0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
FLRT3Q9NZU0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FLRT3Q9NZU0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FLRT3Q9NZU0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FLRT3Q9NZU0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FLRT3Q9NZU0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FLRT3Q9NZU0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
FLRT3Q9NZU0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FLRT3Q9NZU0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
FLRT3Q9NZU0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FLRT3Q9NZU0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FLRT3Q9NZU0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FLRT3Q9NZU0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FLRT3Q9NZU0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FLRT3Q9NZU0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
FLRT3Q9NZU0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FLRT3Q9NZU0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
FLRT3Q9NZU0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FLRT3Q9NZU0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FLRT3Q9NZU0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FLRT3Q9NZU0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FLRT3Q9NZU0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FLRT3Q9NZU0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FLRT3Q9NZU0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FLRT3Q9NZU0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
FLRT3Q9NZU0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
FLRT3Q9NZU0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FLRT3Q9NZU0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FLRT3Q9NZU0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FLRT3Q9NZU0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FLRT3Q9NZU0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FLRT3Q9NZU0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FLRT3Q9NZU0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FLRT3Q9NZU0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FLRT3Q9NZU0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FLRT3Q9NZU0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FLRT3Q9NZU0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FLRT3Q9NZU0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FLRT3Q9NZU0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FLRT3Q9NZU0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FLRT3Q9NZU0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FLRT3Q9NZU0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FLRT3Q9NZU0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FLRT3Q9NZU0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FLRT3Q9NZU0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FLRT3Q9NZU0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FLRT3Q9NZU0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FLRT3Q9NZU0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FLRT3Q9NZU0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FLRT3Q9NZU0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FLRT3Q9NZU0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
FLRT3Q9NZU0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FLRT3Q9NZU0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FLRT3Q9NZU0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FLRT3Q9NZU0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FLRT3Q9NZU0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FLRT3Q9NZU0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FLRT3Q9NZU0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FLRT3Q9NZU0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FLRT3Q9NZU0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FLRT3Q9NZU0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLRT3Q9NZU0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
FLRT3Q9NZU0 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLRT3Q9NZU0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLRT3Q9NZU0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FLRT3Q9NZU0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLRT3Q9NZU0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLRT3Q9NZU0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLRT3Q9NZU0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLRT3Q9NZU0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FLRT3Q9NZU0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms