Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GDAP2Q9NXN4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GDAP2Q9NXN4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GDAP2Q9NXN4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GDAP2Q9NXN4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
GDAP2Q9NXN4 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GDAP2Q9NXN4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GDAP2Q9NXN4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GDAP2Q9NXN4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GDAP2Q9NXN4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GDAP2Q9NXN4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GDAP2Q9NXN4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GDAP2Q9NXN4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GDAP2Q9NXN4 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GDAP2Q9NXN4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GDAP2Q9NXN4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GDAP2Q9NXN4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GDAP2Q9NXN4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GDAP2Q9NXN4 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GDAP2Q9NXN4 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GDAP2Q9NXN4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GDAP2Q9NXN4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GDAP2Q9NXN4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GDAP2Q9NXN4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GDAP2Q9NXN4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GDAP2Q9NXN4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GDAP2Q9NXN4 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GDAP2Q9NXN4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GDAP2Q9NXN4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
GDAP2Q9NXN4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GDAP2Q9NXN4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GDAP2Q9NXN4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
GDAP2Q9NXN4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
GDAP2Q9NXN4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
GDAP2Q9NXN4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GDAP2Q9NXN4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
GDAP2Q9NXN4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GDAP2Q9NXN4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GDAP2Q9NXN4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
GDAP2Q9NXN4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GDAP2Q9NXN4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GDAP2Q9NXN4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
GDAP2Q9NXN4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
GDAP2Q9NXN4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
GDAP2Q9NXN4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GDAP2Q9NXN4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GDAP2Q9NXN4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GDAP2Q9NXN4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
GDAP2Q9NXN4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
GDAP2Q9NXN4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GDAP2Q9NXN4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
GDAP2Q9NXN4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
GDAP2Q9NXN4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
GDAP2Q9NXN4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
GDAP2Q9NXN4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GDAP2Q9NXN4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
GDAP2Q9NXN4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GDAP2Q9NXN4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
GDAP2Q9NXN4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GDAP2Q9NXN4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GDAP2Q9NXN4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
GDAP2Q9NXN4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GDAP2Q9NXN4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
GDAP2Q9NXN4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GDAP2Q9NXN4 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GDAP2Q9NXN4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GDAP2Q9NXN4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GDAP2Q9NXN4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
GDAP2Q9NXN4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
GDAP2Q9NXN4 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GDAP2Q9NXN4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
GDAP2Q9NXN4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
GDAP2Q9NXN4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
GDAP2Q9NXN4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
GDAP2Q9NXN4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GDAP2Q9NXN4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GDAP2Q9NXN4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
GDAP2Q9NXN4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GDAP2Q9NXN4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GDAP2Q9NXN4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GDAP2Q9NXN4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GDAP2Q9NXN4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GDAP2Q9NXN4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GDAP2Q9NXN4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GDAP2Q9NXN4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GDAP2Q9NXN4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GDAP2Q9NXN4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
GDAP2Q9NXN4 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
GDAP2Q9NXN4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GDAP2Q9NXN4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GDAP2Q9NXN4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GDAP2Q9NXN4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GDAP2Q9NXN4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
GDAP2Q9NXN4 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GDAP2Q9NXN4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GDAP2Q9NXN4 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GDAP2Q9NXN4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GDAP2Q9NXN4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GDAP2Q9NXN4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GDAP2Q9NXN4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 162.1 ms