Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FANCLQ9NW38 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FANCLQ9NW38 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
FANCLQ9NW38 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FANCLQ9NW38 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FANCLQ9NW38 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FANCLQ9NW38 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FANCLQ9NW38 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FANCLQ9NW38 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FANCLQ9NW38 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
FANCLQ9NW38 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FANCLQ9NW38 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FANCLQ9NW38 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FANCLQ9NW38 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FANCLQ9NW38 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FANCLQ9NW38 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FANCLQ9NW38 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FANCLQ9NW38 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
FANCLQ9NW38 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FANCLQ9NW38 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FANCLQ9NW38 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FANCLQ9NW38 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FANCLQ9NW38 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
FANCLQ9NW38 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FANCLQ9NW38 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FANCLQ9NW38 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FANCLQ9NW38 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
FANCLQ9NW38 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FANCLQ9NW38 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FANCLQ9NW38 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FANCLQ9NW38 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FANCLQ9NW38 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
FANCLQ9NW38 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FANCLQ9NW38 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FANCLQ9NW38 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FANCLQ9NW38 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FANCLQ9NW38 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FANCLQ9NW38 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FANCLQ9NW38 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FANCLQ9NW38 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FANCLQ9NW38 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FANCLQ9NW38 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FANCLQ9NW38 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FANCLQ9NW38 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FANCLQ9NW38 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FANCLQ9NW38 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FANCLQ9NW38 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FANCLQ9NW38 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FANCLQ9NW38 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FANCLQ9NW38 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FANCLQ9NW38 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FANCLQ9NW38 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FANCLQ9NW38 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FANCLQ9NW38 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FANCLQ9NW38 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FANCLQ9NW38 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FANCLQ9NW38 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FANCLQ9NW38 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FANCLQ9NW38 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FANCLQ9NW38 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FANCLQ9NW38 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FANCLQ9NW38 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FANCLQ9NW38 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FANCLQ9NW38 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FANCLQ9NW38 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FANCLQ9NW38 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FANCLQ9NW38 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FANCLQ9NW38 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
FANCLQ9NW38 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FANCLQ9NW38 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FANCLQ9NW38 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FANCLQ9NW38 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FANCLQ9NW38 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FANCLQ9NW38 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FANCLQ9NW38 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FANCLQ9NW38 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FANCLQ9NW38 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FANCLQ9NW38 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FANCLQ9NW38 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FANCLQ9NW38 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FANCLQ9NW38 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FANCLQ9NW38 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCLQ9NW38 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCLQ9NW38 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCLQ9NW38 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCLQ9NW38 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCLQ9NW38 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCLQ9NW38 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FANCLQ9NW38 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FANCLQ9NW38 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FANCLQ9NW38 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FANCLQ9NW38 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FANCLQ9NW38 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FANCLQ9NW38 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FANCLQ9NW38 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FANCLQ9NW38 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
FANCLQ9NW38 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FANCLQ9NW38 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FANCLQ9NW38 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
FANCLQ9NW38 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms