Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVZ3

NECAP2, Adaptin ear-binding coat-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECAP2Q9NVZ3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NECAP2Q9NVZ3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NECAP2Q9NVZ3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NECAP2Q9NVZ3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NECAP2Q9NVZ3 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NECAP2Q9NVZ3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NECAP2Q9NVZ3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NECAP2Q9NVZ3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NECAP2Q9NVZ3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NECAP2Q9NVZ3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NECAP2Q9NVZ3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NECAP2Q9NVZ3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NECAP2Q9NVZ3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NECAP2Q9NVZ3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NECAP2Q9NVZ3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NECAP2Q9NVZ3 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NECAP2Q9NVZ3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NECAP2Q9NVZ3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NECAP2Q9NVZ3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NECAP2Q9NVZ3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NECAP2Q9NVZ3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NECAP2Q9NVZ3 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NECAP2Q9NVZ3 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NECAP2Q9NVZ3 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NECAP2Q9NVZ3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
NECAP2Q9NVZ3 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
NECAP2Q9NVZ3 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NECAP2Q9NVZ3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NECAP2Q9NVZ3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
NECAP2Q9NVZ3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NECAP2Q9NVZ3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NECAP2Q9NVZ3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NECAP2Q9NVZ3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
NECAP2Q9NVZ3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NECAP2Q9NVZ3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
NECAP2Q9NVZ3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NECAP2Q9NVZ3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NECAP2Q9NVZ3 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NECAP2Q9NVZ3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NECAP2Q9NVZ3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NECAP2Q9NVZ3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NECAP2Q9NVZ3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NECAP2Q9NVZ3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NECAP2Q9NVZ3 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
NECAP2Q9NVZ3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
NECAP2Q9NVZ3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NECAP2Q9NVZ3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NECAP2Q9NVZ3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
NECAP2Q9NVZ3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NECAP2Q9NVZ3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NECAP2Q9NVZ3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
NECAP2Q9NVZ3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NECAP2Q9NVZ3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NECAP2Q9NVZ3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NECAP2Q9NVZ3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NECAP2Q9NVZ3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
NECAP2Q9NVZ3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NECAP2Q9NVZ3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
NECAP2Q9NVZ3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NECAP2Q9NVZ3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NECAP2Q9NVZ3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NECAP2Q9NVZ3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
NECAP2Q9NVZ3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
NECAP2Q9NVZ3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
NECAP2Q9NVZ3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NECAP2Q9NVZ3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NECAP2Q9NVZ3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NECAP2Q9NVZ3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NECAP2Q9NVZ3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NECAP2Q9NVZ3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NECAP2Q9NVZ3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NECAP2Q9NVZ3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NECAP2Q9NVZ3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
NECAP2Q9NVZ3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NECAP2Q9NVZ3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
NECAP2Q9NVZ3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
NECAP2Q9NVZ3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
NECAP2Q9NVZ3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NECAP2Q9NVZ3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
NECAP2Q9NVZ3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NECAP2Q9NVZ3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NECAP2Q9NVZ3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
NECAP2Q9NVZ3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NECAP2Q9NVZ3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NECAP2Q9NVZ3 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NECAP2Q9NVZ3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NECAP2Q9NVZ3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NECAP2Q9NVZ3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NECAP2Q9NVZ3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
NECAP2Q9NVZ3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NECAP2Q9NVZ3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NECAP2Q9NVZ3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NECAP2Q9NVZ3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
NECAP2Q9NVZ3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NECAP2Q9NVZ3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NECAP2Q9NVZ3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NECAP2Q9NVZ3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
NECAP2Q9NVZ3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NECAP2Q9NVZ3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
NECAP2Q9NVZ3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms