Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV29

TMEM100, Transmembrane protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM100Q9NV29 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
TMEM100Q9NV29 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM100Q9NV29 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM100Q9NV29 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM100Q9NV29 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM100Q9NV29 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
TMEM100Q9NV29 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM100Q9NV29 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM100Q9NV29 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM100Q9NV29 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TMEM100Q9NV29 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM100Q9NV29 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM100Q9NV29 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM100Q9NV29 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM100Q9NV29 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM100Q9NV29 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM100Q9NV29 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM100Q9NV29 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TMEM100Q9NV29 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM100Q9NV29 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM100Q9NV29 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM100Q9NV29 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM100Q9NV29 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TMEM100Q9NV29 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM100Q9NV29 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM100Q9NV29 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM100Q9NV29 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TMEM100Q9NV29 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM100Q9NV29 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM100Q9NV29 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM100Q9NV29 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM100Q9NV29 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TMEM100Q9NV29 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM100Q9NV29 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM100Q9NV29 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM100Q9NV29 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TMEM100Q9NV29 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TMEM100Q9NV29 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM100Q9NV29 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM100Q9NV29 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM100Q9NV29 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM100Q9NV29 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM100Q9NV29 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM100Q9NV29 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM100Q9NV29 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM100Q9NV29 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMEM100Q9NV29 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM100Q9NV29 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM100Q9NV29 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM100Q9NV29 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM100Q9NV29 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM100Q9NV29 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMEM100Q9NV29 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM100Q9NV29 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM100Q9NV29 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM100Q9NV29 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM100Q9NV29 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM100Q9NV29 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM100Q9NV29 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM100Q9NV29 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMEM100Q9NV29 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM100Q9NV29 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM100Q9NV29 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM100Q9NV29 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM100Q9NV29 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM100Q9NV29 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM100Q9NV29 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM100Q9NV29 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM100Q9NV29 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMEM100Q9NV29 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM100Q9NV29 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM100Q9NV29 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM100Q9NV29 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMEM100Q9NV29 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMEM100Q9NV29 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMEM100Q9NV29 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM100Q9NV29 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM100Q9NV29 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM100Q9NV29 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM100Q9NV29 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM100Q9NV29 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMEM100Q9NV29 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM100Q9NV29 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM100Q9NV29 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM100Q9NV29 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM100Q9NV29 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM100Q9NV29 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM100Q9NV29 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM100Q9NV29 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM100Q9NV29 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM100Q9NV29 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM100Q9NV29 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM100Q9NV29 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM100Q9NV29 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM100Q9NV29 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TMEM100Q9NV29 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM100Q9NV29 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM100Q9NV29 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM100Q9NV29 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMEM100Q9NV29 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms