Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUP7

TRMT13, tRNA:m(4)X modification enzyme TRM13 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT13Q9NUP7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
TRMT13Q9NUP7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
TRMT13Q9NUP7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TRMT13Q9NUP7 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.54■■■□□ 2
TRMT13Q9NUP7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
TRMT13Q9NUP7 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
TRMT13Q9NUP7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRMT13Q9NUP7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
TRMT13Q9NUP7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
TRMT13Q9NUP7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRMT13Q9NUP7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
TRMT13Q9NUP7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRMT13Q9NUP7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRMT13Q9NUP7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRMT13Q9NUP7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
TRMT13Q9NUP7 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRMT13Q9NUP7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TRMT13Q9NUP7 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRMT13Q9NUP7 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
TRMT13Q9NUP7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC27.52■■■□□ 2
TRMT13Q9NUP7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
TRMT13Q9NUP7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TRMT13Q9NUP7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TRMT13Q9NUP7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
TRMT13Q9NUP7 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRMT13Q9NUP7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
TRMT13Q9NUP7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
TRMT13Q9NUP7 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRMT13Q9NUP7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRMT13Q9NUP7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
TRMT13Q9NUP7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TRMT13Q9NUP7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
TRMT13Q9NUP7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRMT13Q9NUP7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRMT13Q9NUP7 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRMT13Q9NUP7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
TRMT13Q9NUP7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRMT13Q9NUP7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRMT13Q9NUP7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TRMT13Q9NUP7 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
TRMT13Q9NUP7 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRMT13Q9NUP7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
TRMT13Q9NUP7 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRMT13Q9NUP7 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRMT13Q9NUP7 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRMT13Q9NUP7 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRMT13Q9NUP7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRMT13Q9NUP7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
TRMT13Q9NUP7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRMT13Q9NUP7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRMT13Q9NUP7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRMT13Q9NUP7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
TRMT13Q9NUP7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRMT13Q9NUP7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TRMT13Q9NUP7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRMT13Q9NUP7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRMT13Q9NUP7 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRMT13Q9NUP7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TRMT13Q9NUP7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRMT13Q9NUP7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRMT13Q9NUP7 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRMT13Q9NUP7 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRMT13Q9NUP7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRMT13Q9NUP7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
TRMT13Q9NUP7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
TRMT13Q9NUP7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRMT13Q9NUP7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TRMT13Q9NUP7 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
TRMT13Q9NUP7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRMT13Q9NUP7 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRMT13Q9NUP7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TRMT13Q9NUP7 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRMT13Q9NUP7 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRMT13Q9NUP7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRMT13Q9NUP7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TRMT13Q9NUP7 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRMT13Q9NUP7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRMT13Q9NUP7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRMT13Q9NUP7 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRMT13Q9NUP7 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRMT13Q9NUP7 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRMT13Q9NUP7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TRMT13Q9NUP7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TRMT13Q9NUP7 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TRMT13Q9NUP7 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TRMT13Q9NUP7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRMT13Q9NUP7 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRMT13Q9NUP7 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
TRMT13Q9NUP7 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRMT13Q9NUP7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TRMT13Q9NUP7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRMT13Q9NUP7 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRMT13Q9NUP7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TRMT13Q9NUP7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TRMT13Q9NUP7 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRMT13Q9NUP7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRMT13Q9NUP7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRMT13Q9NUP7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TRMT13Q9NUP7 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TRMT13Q9NUP7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.9 ms