Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB8

HOMER2, Homer protein homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER2Q9NSB8 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
HOMER2Q9NSB8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
HOMER2Q9NSB8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
HOMER2Q9NSB8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HOMER2Q9NSB8 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
HOMER2Q9NSB8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HOMER2Q9NSB8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
HOMER2Q9NSB8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
HOMER2Q9NSB8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HOMER2Q9NSB8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
HOMER2Q9NSB8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
HOMER2Q9NSB8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
HOMER2Q9NSB8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HOMER2Q9NSB8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HOMER2Q9NSB8 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
HOMER2Q9NSB8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
HOMER2Q9NSB8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
HOMER2Q9NSB8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HOMER2Q9NSB8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
HOMER2Q9NSB8 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HOMER2Q9NSB8 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HOMER2Q9NSB8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HOMER2Q9NSB8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HOMER2Q9NSB8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
HOMER2Q9NSB8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HOMER2Q9NSB8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
HOMER2Q9NSB8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HOMER2Q9NSB8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HOMER2Q9NSB8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HOMER2Q9NSB8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
HOMER2Q9NSB8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
HOMER2Q9NSB8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
HOMER2Q9NSB8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
HOMER2Q9NSB8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HOMER2Q9NSB8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
HOMER2Q9NSB8 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
HOMER2Q9NSB8 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HOMER2Q9NSB8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
HOMER2Q9NSB8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
HOMER2Q9NSB8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HOMER2Q9NSB8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HOMER2Q9NSB8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HOMER2Q9NSB8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HOMER2Q9NSB8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
HOMER2Q9NSB8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HOMER2Q9NSB8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
HOMER2Q9NSB8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HOMER2Q9NSB8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HOMER2Q9NSB8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
HOMER2Q9NSB8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
HOMER2Q9NSB8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
HOMER2Q9NSB8 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HOMER2Q9NSB8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
HOMER2Q9NSB8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
HOMER2Q9NSB8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
HOMER2Q9NSB8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
HOMER2Q9NSB8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
HOMER2Q9NSB8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HOMER2Q9NSB8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HOMER2Q9NSB8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
HOMER2Q9NSB8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HOMER2Q9NSB8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HOMER2Q9NSB8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HOMER2Q9NSB8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HOMER2Q9NSB8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HOMER2Q9NSB8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HOMER2Q9NSB8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
HOMER2Q9NSB8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HOMER2Q9NSB8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
HOMER2Q9NSB8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HOMER2Q9NSB8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HOMER2Q9NSB8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HOMER2Q9NSB8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HOMER2Q9NSB8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HOMER2Q9NSB8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
HOMER2Q9NSB8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
HOMER2Q9NSB8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
HOMER2Q9NSB8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HOMER2Q9NSB8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HOMER2Q9NSB8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HOMER2Q9NSB8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HOMER2Q9NSB8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HOMER2Q9NSB8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HOMER2Q9NSB8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HOMER2Q9NSB8 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HOMER2Q9NSB8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
HOMER2Q9NSB8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
HOMER2Q9NSB8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HOMER2Q9NSB8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HOMER2Q9NSB8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HOMER2Q9NSB8 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
HOMER2Q9NSB8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HOMER2Q9NSB8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
HOMER2Q9NSB8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HOMER2Q9NSB8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HOMER2Q9NSB8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HOMER2Q9NSB8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HOMER2Q9NSB8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HOMER2Q9NSB8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HOMER2Q9NSB8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms