Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS68

TNFRSF19, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 19, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF19Q9NS68 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFRSF19Q9NS68 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
TNFRSF19Q9NS68 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFRSF19Q9NS68 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFRSF19Q9NS68 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFRSF19Q9NS68 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFRSF19Q9NS68 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFRSF19Q9NS68 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFRSF19Q9NS68 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
TNFRSF19Q9NS68 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF19Q9NS68 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF19Q9NS68 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF19Q9NS68 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF19Q9NS68 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF19Q9NS68 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
TNFRSF19Q9NS68 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF19Q9NS68 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF19Q9NS68 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF19Q9NS68 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF19Q9NS68 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
TNFRSF19Q9NS68 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF19Q9NS68 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF19Q9NS68 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF19Q9NS68 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF19Q9NS68 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF19Q9NS68 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
TNFRSF19Q9NS68 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFRSF19Q9NS68 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFRSF19Q9NS68 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFRSF19Q9NS68 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
TNFRSF19Q9NS68 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFRSF19Q9NS68 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFRSF19Q9NS68 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFRSF19Q9NS68 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFRSF19Q9NS68 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
TNFRSF19Q9NS68 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF19Q9NS68 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF19Q9NS68 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF19Q9NS68 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF19Q9NS68 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF19Q9NS68 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF19Q9NS68 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF19Q9NS68 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF19Q9NS68 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF19Q9NS68 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
TNFRSF19Q9NS68 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF19Q9NS68 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF19Q9NS68 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF19Q9NS68 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF19Q9NS68 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF19Q9NS68 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF19Q9NS68 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF19Q9NS68 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
TNFRSF19Q9NS68 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF19Q9NS68 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF19Q9NS68 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF19Q9NS68 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF19Q9NS68 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TNFRSF19Q9NS68 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF19Q9NS68 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF19Q9NS68 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF19Q9NS68 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF19Q9NS68 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF19Q9NS68 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF19Q9NS68 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF19Q9NS68 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF19Q9NS68 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF19Q9NS68 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TNFRSF19Q9NS68 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF19Q9NS68 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF19Q9NS68 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF19Q9NS68 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF19Q9NS68 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF19Q9NS68 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF19Q9NS68 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF19Q9NS68 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF19Q9NS68 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF19Q9NS68 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TNFRSF19Q9NS68 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF19Q9NS68 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF19Q9NS68 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF19Q9NS68 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF19Q9NS68 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TNFRSF19Q9NS68 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TNFRSF19Q9NS68 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF19Q9NS68 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF19Q9NS68 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF19Q9NS68 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF19Q9NS68 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF19Q9NS68 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF19Q9NS68 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF19Q9NS68 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF19Q9NS68 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF19Q9NS68 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TNFRSF19Q9NS68 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF19Q9NS68 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF19Q9NS68 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF19Q9NS68 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF19Q9NS68 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TNFRSF19Q9NS68 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms