Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GPHNQ9NQX3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GPHNQ9NQX3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GPHNQ9NQX3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
GPHNQ9NQX3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GPHNQ9NQX3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GPHNQ9NQX3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GPHNQ9NQX3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GPHNQ9NQX3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GPHNQ9NQX3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GPHNQ9NQX3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GPHNQ9NQX3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GPHNQ9NQX3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GPHNQ9NQX3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GPHNQ9NQX3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GPHNQ9NQX3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GPHNQ9NQX3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GPHNQ9NQX3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GPHNQ9NQX3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
GPHNQ9NQX3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
GPHNQ9NQX3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GPHNQ9NQX3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GPHNQ9NQX3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GPHNQ9NQX3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
GPHNQ9NQX3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
GPHNQ9NQX3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GPHNQ9NQX3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GPHNQ9NQX3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
GPHNQ9NQX3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
GPHNQ9NQX3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GPHNQ9NQX3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GPHNQ9NQX3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
GPHNQ9NQX3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GPHNQ9NQX3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GPHNQ9NQX3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
GPHNQ9NQX3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
GPHNQ9NQX3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GPHNQ9NQX3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GPHNQ9NQX3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
GPHNQ9NQX3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GPHNQ9NQX3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GPHNQ9NQX3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GPHNQ9NQX3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GPHNQ9NQX3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GPHNQ9NQX3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GPHNQ9NQX3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GPHNQ9NQX3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GPHNQ9NQX3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GPHNQ9NQX3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GPHNQ9NQX3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
GPHNQ9NQX3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GPHNQ9NQX3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GPHNQ9NQX3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GPHNQ9NQX3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GPHNQ9NQX3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GPHNQ9NQX3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GPHNQ9NQX3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GPHNQ9NQX3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GPHNQ9NQX3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GPHNQ9NQX3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GPHNQ9NQX3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GPHNQ9NQX3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GPHNQ9NQX3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GPHNQ9NQX3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GPHNQ9NQX3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GPHNQ9NQX3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GPHNQ9NQX3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GPHNQ9NQX3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GPHNQ9NQX3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GPHNQ9NQX3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GPHNQ9NQX3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GPHNQ9NQX3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GPHNQ9NQX3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GPHNQ9NQX3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GPHNQ9NQX3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GPHNQ9NQX3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GPHNQ9NQX3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GPHNQ9NQX3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GPHNQ9NQX3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
GPHNQ9NQX3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
GPHNQ9NQX3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
GPHNQ9NQX3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GPHNQ9NQX3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
GPHNQ9NQX3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
GPHNQ9NQX3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
GPHNQ9NQX3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
GPHNQ9NQX3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
GPHNQ9NQX3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
GPHNQ9NQX3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
GPHNQ9NQX3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
GPHNQ9NQX3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
GPHNQ9NQX3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
GPHNQ9NQX3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GPHNQ9NQX3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GPHNQ9NQX3 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
GPHNQ9NQX3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GPHNQ9NQX3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
GPHNQ9NQX3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GPHNQ9NQX3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
GPHNQ9NQX3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.1 ms