Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQV7

PRDM9, Histone-lysine N-methyltransferase PRDM9, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM9Q9NQV7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM9Q9NQV7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM9Q9NQV7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRDM9Q9NQV7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM9Q9NQV7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM9Q9NQV7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM9Q9NQV7 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM9Q9NQV7 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM9Q9NQV7 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM9Q9NQV7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM9Q9NQV7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM9Q9NQV7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRDM9Q9NQV7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM9Q9NQV7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM9Q9NQV7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM9Q9NQV7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM9Q9NQV7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRDM9Q9NQV7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM9Q9NQV7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM9Q9NQV7 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM9Q9NQV7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM9Q9NQV7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM9Q9NQV7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM9Q9NQV7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PRDM9Q9NQV7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRDM9Q9NQV7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRDM9Q9NQV7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRDM9Q9NQV7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRDM9Q9NQV7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRDM9Q9NQV7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRDM9Q9NQV7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PRDM9Q9NQV7 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PRDM9Q9NQV7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM9Q9NQV7 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM9Q9NQV7 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM9Q9NQV7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM9Q9NQV7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM9Q9NQV7 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM9Q9NQV7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PRDM9Q9NQV7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM9Q9NQV7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM9Q9NQV7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM9Q9NQV7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PRDM9Q9NQV7 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PRDM9Q9NQV7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRDM9Q9NQV7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRDM9Q9NQV7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRDM9Q9NQV7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRDM9Q9NQV7 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRDM9Q9NQV7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PRDM9Q9NQV7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRDM9Q9NQV7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRDM9Q9NQV7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PRDM9Q9NQV7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRDM9Q9NQV7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRDM9Q9NQV7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRDM9Q9NQV7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRDM9Q9NQV7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRDM9Q9NQV7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PRDM9Q9NQV7 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRDM9Q9NQV7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRDM9Q9NQV7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PRDM9Q9NQV7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM9Q9NQV7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM9Q9NQV7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM9Q9NQV7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM9Q9NQV7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM9Q9NQV7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM9Q9NQV7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
PRDM9Q9NQV7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDM9Q9NQV7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDM9Q9NQV7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDM9Q9NQV7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDM9Q9NQV7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDM9Q9NQV7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDM9Q9NQV7 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PRDM9Q9NQV7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM9Q9NQV7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM9Q9NQV7 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM9Q9NQV7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM9Q9NQV7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM9Q9NQV7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PRDM9Q9NQV7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM9Q9NQV7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM9Q9NQV7 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PRDM9Q9NQV7 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM9Q9NQV7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM9Q9NQV7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM9Q9NQV7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM9Q9NQV7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM9Q9NQV7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM9Q9NQV7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM9Q9NQV7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PRDM9Q9NQV7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDM9Q9NQV7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDM9Q9NQV7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PRDM9Q9NQV7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM9Q9NQV7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM9Q9NQV7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PRDM9Q9NQV7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms