Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GPR88Q9GZN0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GPR88Q9GZN0 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GPR88Q9GZN0 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GPR88Q9GZN0 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
GPR88Q9GZN0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GPR88Q9GZN0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GPR88Q9GZN0 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GPR88Q9GZN0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GPR88Q9GZN0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GPR88Q9GZN0 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GPR88Q9GZN0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GPR88Q9GZN0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GPR88Q9GZN0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GPR88Q9GZN0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GPR88Q9GZN0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GPR88Q9GZN0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GPR88Q9GZN0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GPR88Q9GZN0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GPR88Q9GZN0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GPR88Q9GZN0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GPR88Q9GZN0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GPR88Q9GZN0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GPR88Q9GZN0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GPR88Q9GZN0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GPR88Q9GZN0 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GPR88Q9GZN0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GPR88Q9GZN0 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GPR88Q9GZN0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GPR88Q9GZN0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
GPR88Q9GZN0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GPR88Q9GZN0 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GPR88Q9GZN0 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GPR88Q9GZN0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GPR88Q9GZN0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
GPR88Q9GZN0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GPR88Q9GZN0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
GPR88Q9GZN0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
GPR88Q9GZN0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPR88Q9GZN0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPR88Q9GZN0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
GPR88Q9GZN0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPR88Q9GZN0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
GPR88Q9GZN0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPR88Q9GZN0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
GPR88Q9GZN0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPR88Q9GZN0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPR88Q9GZN0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPR88Q9GZN0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPR88Q9GZN0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
GPR88Q9GZN0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
GPR88Q9GZN0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
GPR88Q9GZN0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPR88Q9GZN0 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPR88Q9GZN0 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPR88Q9GZN0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPR88Q9GZN0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPR88Q9GZN0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPR88Q9GZN0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPR88Q9GZN0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
GPR88Q9GZN0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPR88Q9GZN0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
GPR88Q9GZN0 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPR88Q9GZN0 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPR88Q9GZN0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPR88Q9GZN0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPR88Q9GZN0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
GPR88Q9GZN0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPR88Q9GZN0 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPR88Q9GZN0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
GPR88Q9GZN0 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPR88Q9GZN0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPR88Q9GZN0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
GPR88Q9GZN0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
GPR88Q9GZN0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPR88Q9GZN0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
GPR88Q9GZN0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GPR88Q9GZN0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
GPR88Q9GZN0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GPR88Q9GZN0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
GPR88Q9GZN0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPR88Q9GZN0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPR88Q9GZN0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPR88Q9GZN0 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPR88Q9GZN0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
GPR88Q9GZN0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
GPR88Q9GZN0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GPR88Q9GZN0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GPR88Q9GZN0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
GPR88Q9GZN0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
GPR88Q9GZN0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GPR88Q9GZN0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
GPR88Q9GZN0 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GPR88Q9GZN0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GPR88Q9GZN0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GPR88Q9GZN0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GPR88Q9GZN0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GPR88Q9GZN0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GPR88Q9GZN0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
GPR88Q9GZN0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms