Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY19

MS4A8, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 8, humanhuman

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A8Q9BY19 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
MS4A8Q9BY19 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MS4A8Q9BY19 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
MS4A8Q9BY19 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
MS4A8Q9BY19 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
MS4A8Q9BY19 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MS4A8Q9BY19 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MS4A8Q9BY19 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MS4A8Q9BY19 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MS4A8Q9BY19 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MS4A8Q9BY19 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MS4A8Q9BY19 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MS4A8Q9BY19 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MS4A8Q9BY19 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MS4A8Q9BY19 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MS4A8Q9BY19 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MS4A8Q9BY19 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MS4A8Q9BY19 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MS4A8Q9BY19 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MS4A8Q9BY19 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MS4A8Q9BY19 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MS4A8Q9BY19 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MS4A8Q9BY19 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MS4A8Q9BY19 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MS4A8Q9BY19 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MS4A8Q9BY19 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MS4A8Q9BY19 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MS4A8Q9BY19 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MS4A8Q9BY19 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MS4A8Q9BY19 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MS4A8Q9BY19 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MS4A8Q9BY19 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MS4A8Q9BY19 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MS4A8Q9BY19 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MS4A8Q9BY19 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MS4A8Q9BY19 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MS4A8Q9BY19 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MS4A8Q9BY19 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MS4A8Q9BY19 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MS4A8Q9BY19 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MS4A8Q9BY19 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MS4A8Q9BY19 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MS4A8Q9BY19 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MS4A8Q9BY19 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MS4A8Q9BY19 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MS4A8Q9BY19 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MS4A8Q9BY19 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MS4A8Q9BY19 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MS4A8Q9BY19 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MS4A8Q9BY19 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MS4A8Q9BY19 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MS4A8Q9BY19 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MS4A8Q9BY19 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MS4A8Q9BY19 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MS4A8Q9BY19 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MS4A8Q9BY19 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MS4A8Q9BY19 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MS4A8Q9BY19 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A8Q9BY19 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A8Q9BY19 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A8Q9BY19 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A8Q9BY19 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A8Q9BY19 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A8Q9BY19 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A8Q9BY19 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A8Q9BY19 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A8Q9BY19 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A8Q9BY19 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A8Q9BY19 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A8Q9BY19 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A8Q9BY19 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A8Q9BY19 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A8Q9BY19 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A8Q9BY19 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A8Q9BY19 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A8Q9BY19 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A8Q9BY19 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A8Q9BY19 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MS4A8Q9BY19 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A8Q9BY19 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A8Q9BY19 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A8Q9BY19 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A8Q9BY19 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A8Q9BY19 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A8Q9BY19 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A8Q9BY19 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MS4A8Q9BY19 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MS4A8Q9BY19 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A8Q9BY19 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A8Q9BY19 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A8Q9BY19 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A8Q9BY19 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A8Q9BY19 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A8Q9BY19 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MS4A8Q9BY19 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A8Q9BY19 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MS4A8Q9BY19 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A8Q9BY19 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A8Q9BY19 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MS4A8Q9BY19 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms