Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVI0

PHF20, PHD finger protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF20Q9BVI0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PHF20Q9BVI0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PHF20Q9BVI0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PHF20Q9BVI0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PHF20Q9BVI0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PHF20Q9BVI0 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PHF20Q9BVI0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PHF20Q9BVI0 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PHF20Q9BVI0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHF20Q9BVI0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHF20Q9BVI0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHF20Q9BVI0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PHF20Q9BVI0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHF20Q9BVI0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHF20Q9BVI0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHF20Q9BVI0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHF20Q9BVI0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PHF20Q9BVI0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHF20Q9BVI0 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHF20Q9BVI0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHF20Q9BVI0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHF20Q9BVI0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHF20Q9BVI0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHF20Q9BVI0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PHF20Q9BVI0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHF20Q9BVI0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHF20Q9BVI0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHF20Q9BVI0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHF20Q9BVI0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHF20Q9BVI0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PHF20Q9BVI0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PHF20Q9BVI0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PHF20Q9BVI0 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PHF20Q9BVI0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PHF20Q9BVI0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PHF20Q9BVI0 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PHF20Q9BVI0 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PHF20Q9BVI0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PHF20Q9BVI0 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PHF20Q9BVI0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PHF20Q9BVI0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PHF20Q9BVI0 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PHF20Q9BVI0 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PHF20Q9BVI0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PHF20Q9BVI0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PHF20Q9BVI0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PHF20Q9BVI0 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PHF20Q9BVI0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PHF20Q9BVI0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PHF20Q9BVI0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PHF20Q9BVI0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PHF20Q9BVI0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PHF20Q9BVI0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PHF20Q9BVI0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHF20Q9BVI0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHF20Q9BVI0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHF20Q9BVI0 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHF20Q9BVI0 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHF20Q9BVI0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHF20Q9BVI0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PHF20Q9BVI0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PHF20Q9BVI0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PHF20Q9BVI0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PHF20Q9BVI0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PHF20Q9BVI0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PHF20Q9BVI0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PHF20Q9BVI0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHF20Q9BVI0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHF20Q9BVI0 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHF20Q9BVI0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PHF20Q9BVI0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PHF20Q9BVI0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PHF20Q9BVI0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PHF20Q9BVI0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PHF20Q9BVI0 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PHF20Q9BVI0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PHF20Q9BVI0 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHF20Q9BVI0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHF20Q9BVI0 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHF20Q9BVI0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
PHF20Q9BVI0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHF20Q9BVI0 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHF20Q9BVI0 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PHF20Q9BVI0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHF20Q9BVI0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHF20Q9BVI0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PHF20Q9BVI0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PHF20Q9BVI0 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PHF20Q9BVI0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PHF20Q9BVI0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PHF20Q9BVI0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PHF20Q9BVI0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PHF20Q9BVI0 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
PHF20Q9BVI0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHF20Q9BVI0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHF20Q9BVI0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHF20Q9BVI0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PHF20Q9BVI0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHF20Q9BVI0 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PHF20Q9BVI0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms