Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRG1

VPS25, Vacuolar protein-sorting-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS25Q9BRG1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
VPS25Q9BRG1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
VPS25Q9BRG1 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
VPS25Q9BRG1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
VPS25Q9BRG1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VPS25Q9BRG1 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VPS25Q9BRG1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VPS25Q9BRG1 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
VPS25Q9BRG1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VPS25Q9BRG1 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VPS25Q9BRG1 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
VPS25Q9BRG1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VPS25Q9BRG1 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VPS25Q9BRG1 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VPS25Q9BRG1 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VPS25Q9BRG1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VPS25Q9BRG1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VPS25Q9BRG1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VPS25Q9BRG1 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VPS25Q9BRG1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
VPS25Q9BRG1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
VPS25Q9BRG1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VPS25Q9BRG1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VPS25Q9BRG1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VPS25Q9BRG1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VPS25Q9BRG1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VPS25Q9BRG1 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
VPS25Q9BRG1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VPS25Q9BRG1 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VPS25Q9BRG1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VPS25Q9BRG1 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
VPS25Q9BRG1 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
VPS25Q9BRG1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
VPS25Q9BRG1 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
VPS25Q9BRG1 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VPS25Q9BRG1 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
VPS25Q9BRG1 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VPS25Q9BRG1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
VPS25Q9BRG1 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPS25Q9BRG1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPS25Q9BRG1 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPS25Q9BRG1 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPS25Q9BRG1 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPS25Q9BRG1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPS25Q9BRG1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPS25Q9BRG1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPS25Q9BRG1 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPS25Q9BRG1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
VPS25Q9BRG1 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VPS25Q9BRG1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VPS25Q9BRG1 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VPS25Q9BRG1 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
VPS25Q9BRG1 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VPS25Q9BRG1 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VPS25Q9BRG1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VPS25Q9BRG1 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
VPS25Q9BRG1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VPS25Q9BRG1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
VPS25Q9BRG1 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPS25Q9BRG1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPS25Q9BRG1 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPS25Q9BRG1 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPS25Q9BRG1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPS25Q9BRG1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPS25Q9BRG1 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPS25Q9BRG1 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPS25Q9BRG1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPS25Q9BRG1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPS25Q9BRG1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
VPS25Q9BRG1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VPS25Q9BRG1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VPS25Q9BRG1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VPS25Q9BRG1 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
VPS25Q9BRG1 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
VPS25Q9BRG1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VPS25Q9BRG1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VPS25Q9BRG1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VPS25Q9BRG1 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
VPS25Q9BRG1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VPS25Q9BRG1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
VPS25Q9BRG1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPS25Q9BRG1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPS25Q9BRG1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPS25Q9BRG1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPS25Q9BRG1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPS25Q9BRG1 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
VPS25Q9BRG1 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VPS25Q9BRG1 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VPS25Q9BRG1 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VPS25Q9BRG1 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
VPS25Q9BRG1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VPS25Q9BRG1 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
VPS25Q9BRG1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPS25Q9BRG1 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPS25Q9BRG1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPS25Q9BRG1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPS25Q9BRG1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPS25Q9BRG1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
VPS25Q9BRG1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
VPS25Q9BRG1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.4 ms