Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLF1Q9BQI6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLF1Q9BQI6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
SLF1Q9BQI6 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLF1Q9BQI6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLF1Q9BQI6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLF1Q9BQI6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SLF1Q9BQI6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLF1Q9BQI6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLF1Q9BQI6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLF1Q9BQI6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLF1Q9BQI6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
SLF1Q9BQI6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLF1Q9BQI6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLF1Q9BQI6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SLF1Q9BQI6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLF1Q9BQI6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLF1Q9BQI6 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SLF1Q9BQI6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLF1Q9BQI6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLF1Q9BQI6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLF1Q9BQI6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SLF1Q9BQI6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLF1Q9BQI6 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
SLF1Q9BQI6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLF1Q9BQI6 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
SLF1Q9BQI6 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLF1Q9BQI6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLF1Q9BQI6 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLF1Q9BQI6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SLF1Q9BQI6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLF1Q9BQI6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLF1Q9BQI6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLF1Q9BQI6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLF1Q9BQI6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SLF1Q9BQI6 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
SLF1Q9BQI6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SLF1Q9BQI6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLF1Q9BQI6 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLF1Q9BQI6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLF1Q9BQI6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLF1Q9BQI6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLF1Q9BQI6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
SLF1Q9BQI6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SLF1Q9BQI6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
SLF1Q9BQI6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
SLF1Q9BQI6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
SLF1Q9BQI6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLF1Q9BQI6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLF1Q9BQI6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SLF1Q9BQI6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLF1Q9BQI6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLF1Q9BQI6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLF1Q9BQI6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SLF1Q9BQI6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLF1Q9BQI6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLF1Q9BQI6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
SLF1Q9BQI6 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLF1Q9BQI6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SLF1Q9BQI6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLF1Q9BQI6 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLF1Q9BQI6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLF1Q9BQI6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLF1Q9BQI6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLF1Q9BQI6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLF1Q9BQI6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SLF1Q9BQI6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLF1Q9BQI6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLF1Q9BQI6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SLF1Q9BQI6 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SLF1Q9BQI6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLF1Q9BQI6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLF1Q9BQI6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SLF1Q9BQI6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
SLF1Q9BQI6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLF1Q9BQI6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SLF1Q9BQI6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
SLF1Q9BQI6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLF1Q9BQI6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLF1Q9BQI6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLF1Q9BQI6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLF1Q9BQI6 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
SLF1Q9BQI6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLF1Q9BQI6 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLF1Q9BQI6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SLF1Q9BQI6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLF1Q9BQI6 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SLF1Q9BQI6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLF1Q9BQI6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLF1Q9BQI6 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLF1Q9BQI6 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLF1Q9BQI6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLF1Q9BQI6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SLF1Q9BQI6 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SLF1Q9BQI6 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLF1Q9BQI6 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SLF1Q9BQI6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
SLF1Q9BQI6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLF1Q9BQI6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SLF1Q9BQI6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms