Protein–RNA interactions for Protein: Q96S65

CSRNP1, Cysteine/serine-rich nuclear protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP1Q96S65 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CSRNP1Q96S65 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CSRNP1Q96S65 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
CSRNP1Q96S65 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CSRNP1Q96S65 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CSRNP1Q96S65 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CSRNP1Q96S65 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CSRNP1Q96S65 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CSRNP1Q96S65 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CSRNP1Q96S65 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CSRNP1Q96S65 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CSRNP1Q96S65 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CSRNP1Q96S65 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CSRNP1Q96S65 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CSRNP1Q96S65 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CSRNP1Q96S65 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CSRNP1Q96S65 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CSRNP1Q96S65 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CSRNP1Q96S65 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CSRNP1Q96S65 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CSRNP1Q96S65 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CSRNP1Q96S65 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CSRNP1Q96S65 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CSRNP1Q96S65 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CSRNP1Q96S65 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CSRNP1Q96S65 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CSRNP1Q96S65 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CSRNP1Q96S65 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CSRNP1Q96S65 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CSRNP1Q96S65 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CSRNP1Q96S65 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CSRNP1Q96S65 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CSRNP1Q96S65 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CSRNP1Q96S65 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CSRNP1Q96S65 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CSRNP1Q96S65 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
CSRNP1Q96S65 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CSRNP1Q96S65 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CSRNP1Q96S65 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CSRNP1Q96S65 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CSRNP1Q96S65 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CSRNP1Q96S65 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CSRNP1Q96S65 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CSRNP1Q96S65 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CSRNP1Q96S65 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CSRNP1Q96S65 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CSRNP1Q96S65 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CSRNP1Q96S65 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CSRNP1Q96S65 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CSRNP1Q96S65 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CSRNP1Q96S65 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CSRNP1Q96S65 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CSRNP1Q96S65 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CSRNP1Q96S65 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CSRNP1Q96S65 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CSRNP1Q96S65 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CSRNP1Q96S65 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CSRNP1Q96S65 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CSRNP1Q96S65 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CSRNP1Q96S65 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CSRNP1Q96S65 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CSRNP1Q96S65 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CSRNP1Q96S65 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CSRNP1Q96S65 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CSRNP1Q96S65 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
CSRNP1Q96S65 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CSRNP1Q96S65 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CSRNP1Q96S65 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CSRNP1Q96S65 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
CSRNP1Q96S65 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
CSRNP1Q96S65 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
CSRNP1Q96S65 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CSRNP1Q96S65 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CSRNP1Q96S65 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CSRNP1Q96S65 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CSRNP1Q96S65 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CSRNP1Q96S65 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
CSRNP1Q96S65 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
CSRNP1Q96S65 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
CSRNP1Q96S65 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
CSRNP1Q96S65 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CSRNP1Q96S65 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
CSRNP1Q96S65 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CSRNP1Q96S65 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
CSRNP1Q96S65 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
CSRNP1Q96S65 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CSRNP1Q96S65 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
CSRNP1Q96S65 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CSRNP1Q96S65 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CSRNP1Q96S65 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CSRNP1Q96S65 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CSRNP1Q96S65 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CSRNP1Q96S65 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CSRNP1Q96S65 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
CSRNP1Q96S65 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CSRNP1Q96S65 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
CSRNP1Q96S65 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
CSRNP1Q96S65 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CSRNP1Q96S65 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
CSRNP1Q96S65 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms