Protein–RNA interactions for Protein: Q96RL1

UIMC1, BRCA1-A complex subunit RAP80, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UIMC1Q96RL1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
UIMC1Q96RL1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
UIMC1Q96RL1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UIMC1Q96RL1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UIMC1Q96RL1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
UIMC1Q96RL1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
UIMC1Q96RL1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UIMC1Q96RL1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
UIMC1Q96RL1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
UIMC1Q96RL1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
UIMC1Q96RL1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UIMC1Q96RL1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
UIMC1Q96RL1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
UIMC1Q96RL1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UIMC1Q96RL1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
UIMC1Q96RL1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
UIMC1Q96RL1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UIMC1Q96RL1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UIMC1Q96RL1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
UIMC1Q96RL1 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
UIMC1Q96RL1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
UIMC1Q96RL1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
UIMC1Q96RL1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UIMC1Q96RL1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UIMC1Q96RL1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
UIMC1Q96RL1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UIMC1Q96RL1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UIMC1Q96RL1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
UIMC1Q96RL1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UIMC1Q96RL1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UIMC1Q96RL1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
UIMC1Q96RL1 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
UIMC1Q96RL1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
UIMC1Q96RL1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
UIMC1Q96RL1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
UIMC1Q96RL1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
UIMC1Q96RL1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UIMC1Q96RL1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UIMC1Q96RL1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UIMC1Q96RL1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
UIMC1Q96RL1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UIMC1Q96RL1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UIMC1Q96RL1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UIMC1Q96RL1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
UIMC1Q96RL1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
UIMC1Q96RL1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UIMC1Q96RL1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
UIMC1Q96RL1 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UIMC1Q96RL1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
UIMC1Q96RL1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
UIMC1Q96RL1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UIMC1Q96RL1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
UIMC1Q96RL1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UIMC1Q96RL1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
UIMC1Q96RL1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
UIMC1Q96RL1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
UIMC1Q96RL1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UIMC1Q96RL1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
UIMC1Q96RL1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UIMC1Q96RL1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UIMC1Q96RL1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
UIMC1Q96RL1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UIMC1Q96RL1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UIMC1Q96RL1 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UIMC1Q96RL1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UIMC1Q96RL1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UIMC1Q96RL1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
UIMC1Q96RL1 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UIMC1Q96RL1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UIMC1Q96RL1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UIMC1Q96RL1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UIMC1Q96RL1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UIMC1Q96RL1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UIMC1Q96RL1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
UIMC1Q96RL1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
UIMC1Q96RL1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UIMC1Q96RL1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
UIMC1Q96RL1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
UIMC1Q96RL1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
UIMC1Q96RL1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
UIMC1Q96RL1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UIMC1Q96RL1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UIMC1Q96RL1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UIMC1Q96RL1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UIMC1Q96RL1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UIMC1Q96RL1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UIMC1Q96RL1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UIMC1Q96RL1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UIMC1Q96RL1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UIMC1Q96RL1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
UIMC1Q96RL1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
UIMC1Q96RL1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UIMC1Q96RL1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UIMC1Q96RL1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UIMC1Q96RL1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
UIMC1Q96RL1 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
UIMC1Q96RL1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UIMC1Q96RL1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UIMC1Q96RL1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UIMC1Q96RL1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.8 ms