Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SORCS2Q96PQ0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SORCS2Q96PQ0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SORCS2Q96PQ0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SORCS2Q96PQ0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SORCS2Q96PQ0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SORCS2Q96PQ0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SORCS2Q96PQ0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SORCS2Q96PQ0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SORCS2Q96PQ0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SORCS2Q96PQ0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SORCS2Q96PQ0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SORCS2Q96PQ0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SORCS2Q96PQ0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SORCS2Q96PQ0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SORCS2Q96PQ0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SORCS2Q96PQ0 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SORCS2Q96PQ0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SORCS2Q96PQ0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SORCS2Q96PQ0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SORCS2Q96PQ0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SORCS2Q96PQ0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SORCS2Q96PQ0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SORCS2Q96PQ0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SORCS2Q96PQ0 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SORCS2Q96PQ0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SORCS2Q96PQ0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SORCS2Q96PQ0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SORCS2Q96PQ0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SORCS2Q96PQ0 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SORCS2Q96PQ0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SORCS2Q96PQ0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SORCS2Q96PQ0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SORCS2Q96PQ0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SORCS2Q96PQ0 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SORCS2Q96PQ0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SORCS2Q96PQ0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SORCS2Q96PQ0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SORCS2Q96PQ0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SORCS2Q96PQ0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SORCS2Q96PQ0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SORCS2Q96PQ0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SORCS2Q96PQ0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SORCS2Q96PQ0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SORCS2Q96PQ0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SORCS2Q96PQ0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SORCS2Q96PQ0 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SORCS2Q96PQ0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SORCS2Q96PQ0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SORCS2Q96PQ0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SORCS2Q96PQ0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SORCS2Q96PQ0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SORCS2Q96PQ0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SORCS2Q96PQ0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SORCS2Q96PQ0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SORCS2Q96PQ0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SORCS2Q96PQ0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SORCS2Q96PQ0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SORCS2Q96PQ0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SORCS2Q96PQ0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SORCS2Q96PQ0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SORCS2Q96PQ0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SORCS2Q96PQ0 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SORCS2Q96PQ0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SORCS2Q96PQ0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SORCS2Q96PQ0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SORCS2Q96PQ0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SORCS2Q96PQ0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SORCS2Q96PQ0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SORCS2Q96PQ0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SORCS2Q96PQ0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SORCS2Q96PQ0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SORCS2Q96PQ0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SORCS2Q96PQ0 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SORCS2Q96PQ0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SORCS2Q96PQ0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SORCS2Q96PQ0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SORCS2Q96PQ0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SORCS2Q96PQ0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SORCS2Q96PQ0 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SORCS2Q96PQ0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SORCS2Q96PQ0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SORCS2Q96PQ0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SORCS2Q96PQ0 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SORCS2Q96PQ0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SORCS2Q96PQ0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SORCS2Q96PQ0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SORCS2Q96PQ0 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SORCS2Q96PQ0 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SORCS2Q96PQ0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SORCS2Q96PQ0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SORCS2Q96PQ0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SORCS2Q96PQ0 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SORCS2Q96PQ0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SORCS2Q96PQ0 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SORCS2Q96PQ0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SORCS2Q96PQ0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SORCS2Q96PQ0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SORCS2Q96PQ0 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SORCS2Q96PQ0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms