Protein–RNA interactions for Protein: Q96EE4

CCDC126, Coiled-coil domain-containing protein 126, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC126Q96EE4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC126Q96EE4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC126Q96EE4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CCDC126Q96EE4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CCDC126Q96EE4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC126Q96EE4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC126Q96EE4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC126Q96EE4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC126Q96EE4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC126Q96EE4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC126Q96EE4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC126Q96EE4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CCDC126Q96EE4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC126Q96EE4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC126Q96EE4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CCDC126Q96EE4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC126Q96EE4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC126Q96EE4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC126Q96EE4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC126Q96EE4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC126Q96EE4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC126Q96EE4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC126Q96EE4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC126Q96EE4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC126Q96EE4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC126Q96EE4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC126Q96EE4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC126Q96EE4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC126Q96EE4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC126Q96EE4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC126Q96EE4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC126Q96EE4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC126Q96EE4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC126Q96EE4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC126Q96EE4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC126Q96EE4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC126Q96EE4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC126Q96EE4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC126Q96EE4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC126Q96EE4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC126Q96EE4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC126Q96EE4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC126Q96EE4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC126Q96EE4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC126Q96EE4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC126Q96EE4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC126Q96EE4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC126Q96EE4 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC126Q96EE4 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC126Q96EE4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC126Q96EE4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC126Q96EE4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC126Q96EE4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC126Q96EE4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC126Q96EE4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC126Q96EE4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC126Q96EE4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC126Q96EE4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC126Q96EE4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC126Q96EE4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC126Q96EE4 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC126Q96EE4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC126Q96EE4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC126Q96EE4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC126Q96EE4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CCDC126Q96EE4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC126Q96EE4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CCDC126Q96EE4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CCDC126Q96EE4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC126Q96EE4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC126Q96EE4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC126Q96EE4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC126Q96EE4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC126Q96EE4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC126Q96EE4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CCDC126Q96EE4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC126Q96EE4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CCDC126Q96EE4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC126Q96EE4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC126Q96EE4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC126Q96EE4 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC126Q96EE4 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC126Q96EE4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC126Q96EE4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC126Q96EE4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC126Q96EE4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC126Q96EE4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CCDC126Q96EE4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC126Q96EE4 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC126Q96EE4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC126Q96EE4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC126Q96EE4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC126Q96EE4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CCDC126Q96EE4 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC126Q96EE4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC126Q96EE4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC126Q96EE4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC126Q96EE4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC126Q96EE4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CCDC126Q96EE4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms