Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTERF3Q96E29 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTERF3Q96E29 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTERF3Q96E29 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTERF3Q96E29 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTERF3Q96E29 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTERF3Q96E29 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTERF3Q96E29 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MTERF3Q96E29 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTERF3Q96E29 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTERF3Q96E29 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTERF3Q96E29 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MTERF3Q96E29 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MTERF3Q96E29 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MTERF3Q96E29 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTERF3Q96E29 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTERF3Q96E29 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTERF3Q96E29 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTERF3Q96E29 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTERF3Q96E29 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MTERF3Q96E29 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTERF3Q96E29 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTERF3Q96E29 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MTERF3Q96E29 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTERF3Q96E29 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTERF3Q96E29 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTERF3Q96E29 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTERF3Q96E29 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MTERF3Q96E29 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTERF3Q96E29 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTERF3Q96E29 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTERF3Q96E29 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MTERF3Q96E29 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MTERF3Q96E29 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MTERF3Q96E29 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MTERF3Q96E29 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MTERF3Q96E29 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTERF3Q96E29 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTERF3Q96E29 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTERF3Q96E29 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTERF3Q96E29 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTERF3Q96E29 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTERF3Q96E29 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTERF3Q96E29 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MTERF3Q96E29 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTERF3Q96E29 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTERF3Q96E29 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTERF3Q96E29 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MTERF3Q96E29 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTERF3Q96E29 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTERF3Q96E29 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTERF3Q96E29 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTERF3Q96E29 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTERF3Q96E29 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MTERF3Q96E29 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MTERF3Q96E29 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTERF3Q96E29 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTERF3Q96E29 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTERF3Q96E29 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTERF3Q96E29 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTERF3Q96E29 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTERF3Q96E29 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTERF3Q96E29 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTERF3Q96E29 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTERF3Q96E29 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTERF3Q96E29 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MTERF3Q96E29 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTERF3Q96E29 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTERF3Q96E29 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTERF3Q96E29 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTERF3Q96E29 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTERF3Q96E29 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MTERF3Q96E29 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTERF3Q96E29 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTERF3Q96E29 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MTERF3Q96E29 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTERF3Q96E29 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTERF3Q96E29 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTERF3Q96E29 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTERF3Q96E29 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTERF3Q96E29 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MTERF3Q96E29 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTERF3Q96E29 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTERF3Q96E29 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTERF3Q96E29 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTERF3Q96E29 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTERF3Q96E29 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTERF3Q96E29 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTERF3Q96E29 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTERF3Q96E29 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MTERF3Q96E29 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MTERF3Q96E29 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTERF3Q96E29 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTERF3Q96E29 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MTERF3Q96E29 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTERF3Q96E29 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTERF3Q96E29 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MTERF3Q96E29 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTERF3Q96E29 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MTERF3Q96E29 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.8 ms