Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP6

GRAMD1A, GRAM domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1AQ96CP6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GRAMD1AQ96CP6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRAMD1AQ96CP6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRAMD1AQ96CP6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GRAMD1AQ96CP6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GRAMD1AQ96CP6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
GRAMD1AQ96CP6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRAMD1AQ96CP6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRAMD1AQ96CP6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRAMD1AQ96CP6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRAMD1AQ96CP6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRAMD1AQ96CP6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRAMD1AQ96CP6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GRAMD1AQ96CP6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRAMD1AQ96CP6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRAMD1AQ96CP6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRAMD1AQ96CP6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRAMD1AQ96CP6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRAMD1AQ96CP6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GRAMD1AQ96CP6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GRAMD1AQ96CP6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GRAMD1AQ96CP6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GRAMD1AQ96CP6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRAMD1AQ96CP6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRAMD1AQ96CP6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GRAMD1AQ96CP6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRAMD1AQ96CP6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRAMD1AQ96CP6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRAMD1AQ96CP6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRAMD1AQ96CP6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GRAMD1AQ96CP6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRAMD1AQ96CP6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRAMD1AQ96CP6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRAMD1AQ96CP6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRAMD1AQ96CP6 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRAMD1AQ96CP6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRAMD1AQ96CP6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GRAMD1AQ96CP6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRAMD1AQ96CP6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRAMD1AQ96CP6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRAMD1AQ96CP6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRAMD1AQ96CP6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GRAMD1AQ96CP6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRAMD1AQ96CP6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRAMD1AQ96CP6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRAMD1AQ96CP6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GRAMD1AQ96CP6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRAMD1AQ96CP6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GRAMD1AQ96CP6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRAMD1AQ96CP6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRAMD1AQ96CP6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GRAMD1AQ96CP6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRAMD1AQ96CP6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRAMD1AQ96CP6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GRAMD1AQ96CP6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRAMD1AQ96CP6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GRAMD1AQ96CP6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GRAMD1AQ96CP6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRAMD1AQ96CP6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRAMD1AQ96CP6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRAMD1AQ96CP6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRAMD1AQ96CP6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GRAMD1AQ96CP6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRAMD1AQ96CP6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRAMD1AQ96CP6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRAMD1AQ96CP6 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GRAMD1AQ96CP6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRAMD1AQ96CP6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRAMD1AQ96CP6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRAMD1AQ96CP6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GRAMD1AQ96CP6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRAMD1AQ96CP6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GRAMD1AQ96CP6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRAMD1AQ96CP6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GRAMD1AQ96CP6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRAMD1AQ96CP6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRAMD1AQ96CP6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRAMD1AQ96CP6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRAMD1AQ96CP6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRAMD1AQ96CP6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
GRAMD1AQ96CP6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GRAMD1AQ96CP6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRAMD1AQ96CP6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRAMD1AQ96CP6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GRAMD1AQ96CP6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRAMD1AQ96CP6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRAMD1AQ96CP6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRAMD1AQ96CP6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRAMD1AQ96CP6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRAMD1AQ96CP6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GRAMD1AQ96CP6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRAMD1AQ96CP6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRAMD1AQ96CP6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GRAMD1AQ96CP6 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRAMD1AQ96CP6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GRAMD1AQ96CP6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRAMD1AQ96CP6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRAMD1AQ96CP6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRAMD1AQ96CP6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GRAMD1AQ96CP6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.7 ms