Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC47Q96A33 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC47Q96A33 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC47Q96A33 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
CCDC47Q96A33 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC47Q96A33 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC47Q96A33 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
CCDC47Q96A33 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC47Q96A33 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC47Q96A33 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC47Q96A33 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CCDC47Q96A33 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC47Q96A33 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CCDC47Q96A33 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC47Q96A33 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC47Q96A33 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC47Q96A33 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC47Q96A33 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CCDC47Q96A33 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC47Q96A33 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC47Q96A33 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CCDC47Q96A33 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC47Q96A33 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC47Q96A33 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
CCDC47Q96A33 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC47Q96A33 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC47Q96A33 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC47Q96A33 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC47Q96A33 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CCDC47Q96A33 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC47Q96A33 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC47Q96A33 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC47Q96A33 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC47Q96A33 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC47Q96A33 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC47Q96A33 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC47Q96A33 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC47Q96A33 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CCDC47Q96A33 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC47Q96A33 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC47Q96A33 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC47Q96A33 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC47Q96A33 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CCDC47Q96A33 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC47Q96A33 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC47Q96A33 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC47Q96A33 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC47Q96A33 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC47Q96A33 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC47Q96A33 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC47Q96A33 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC47Q96A33 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC47Q96A33 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC47Q96A33 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CCDC47Q96A33 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC47Q96A33 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC47Q96A33 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC47Q96A33 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CCDC47Q96A33 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC47Q96A33 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
CCDC47Q96A33 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC47Q96A33 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC47Q96A33 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC47Q96A33 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
CCDC47Q96A33 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC47Q96A33 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC47Q96A33 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC47Q96A33 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC47Q96A33 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC47Q96A33 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC47Q96A33 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC47Q96A33 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CCDC47Q96A33 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC47Q96A33 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC47Q96A33 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CCDC47Q96A33 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC47Q96A33 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CCDC47Q96A33 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC47Q96A33 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC47Q96A33 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC47Q96A33 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CCDC47Q96A33 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC47Q96A33 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC47Q96A33 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC47Q96A33 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC47Q96A33 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CCDC47Q96A33 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC47Q96A33 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CCDC47Q96A33 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CCDC47Q96A33 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC47Q96A33 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC47Q96A33 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC47Q96A33 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC47Q96A33 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CCDC47Q96A33 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC47Q96A33 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CCDC47Q96A33 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC47Q96A33 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC47Q96A33 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CCDC47Q96A33 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms