Protein–RNA interactions for Protein: Q92771

DDX12P, Putative ATP-dependent RNA helicase DDX12, humanhuman

Predictions only

Length 950 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX12PQ92771 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX12PQ92771 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DDX12PQ92771 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX12PQ92771 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX12PQ92771 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX12PQ92771 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
DDX12PQ92771 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX12PQ92771 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX12PQ92771 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX12PQ92771 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX12PQ92771 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX12PQ92771 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DDX12PQ92771 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX12PQ92771 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX12PQ92771 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
DDX12PQ92771 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX12PQ92771 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX12PQ92771 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DDX12PQ92771 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX12PQ92771 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX12PQ92771 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX12PQ92771 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX12PQ92771 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DDX12PQ92771 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX12PQ92771 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX12PQ92771 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX12PQ92771 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX12PQ92771 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX12PQ92771 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX12PQ92771 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX12PQ92771 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX12PQ92771 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DDX12PQ92771 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DDX12PQ92771 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DDX12PQ92771 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DDX12PQ92771 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DDX12PQ92771 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DDX12PQ92771 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
DDX12PQ92771 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
DDX12PQ92771 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.55■■■□□ 2
DDX12PQ92771 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDX12PQ92771 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDX12PQ92771 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDX12PQ92771 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
DDX12PQ92771 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDX12PQ92771 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DDX12PQ92771 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
DDX12PQ92771 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DDX12PQ92771 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DDX12PQ92771 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DDX12PQ92771 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
DDX12PQ92771 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DDX12PQ92771 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
DDX12PQ92771 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DDX12PQ92771 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
DDX12PQ92771 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DDX12PQ92771 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DDX12PQ92771 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
DDX12PQ92771 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
DDX12PQ92771 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
DDX12PQ92771 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX12PQ92771 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
DDX12PQ92771 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX12PQ92771 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX12PQ92771 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX12PQ92771 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX12PQ92771 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX12PQ92771 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DDX12PQ92771 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX12PQ92771 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX12PQ92771 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX12PQ92771 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
DDX12PQ92771 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX12PQ92771 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX12PQ92771 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX12PQ92771 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX12PQ92771 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX12PQ92771 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
DDX12PQ92771 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX12PQ92771 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX12PQ92771 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX12PQ92771 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX12PQ92771 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX12PQ92771 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX12PQ92771 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX12PQ92771 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX12PQ92771 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX12PQ92771 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX12PQ92771 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
DDX12PQ92771 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX12PQ92771 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX12PQ92771 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX12PQ92771 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX12PQ92771 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX12PQ92771 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
DDX12PQ92771 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDX12PQ92771 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDX12PQ92771 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
DDX12PQ92771 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
DDX12PQ92771 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.7 ms