Protein–RNA interactions for Protein: Q92620

DHX38, Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX38Q92620 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
DHX38Q92620 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
DHX38Q92620 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
DHX38Q92620 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
DHX38Q92620 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
DHX38Q92620 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DHX38Q92620 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
DHX38Q92620 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DHX38Q92620 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DHX38Q92620 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DHX38Q92620 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
DHX38Q92620 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DHX38Q92620 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
DHX38Q92620 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DHX38Q92620 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DHX38Q92620 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
DHX38Q92620 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DHX38Q92620 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
DHX38Q92620 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
DHX38Q92620 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DHX38Q92620 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DHX38Q92620 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
DHX38Q92620 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
DHX38Q92620 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DHX38Q92620 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DHX38Q92620 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
DHX38Q92620 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
DHX38Q92620 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DHX38Q92620 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DHX38Q92620 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DHX38Q92620 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DHX38Q92620 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DHX38Q92620 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
DHX38Q92620 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
DHX38Q92620 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
DHX38Q92620 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DHX38Q92620 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DHX38Q92620 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DHX38Q92620 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
DHX38Q92620 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
DHX38Q92620 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
DHX38Q92620 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DHX38Q92620 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DHX38Q92620 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DHX38Q92620 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DHX38Q92620 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DHX38Q92620 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DHX38Q92620 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
DHX38Q92620 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
DHX38Q92620 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
DHX38Q92620 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DHX38Q92620 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
DHX38Q92620 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DHX38Q92620 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DHX38Q92620 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
DHX38Q92620 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DHX38Q92620 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DHX38Q92620 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DHX38Q92620 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
DHX38Q92620 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
DHX38Q92620 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.56■■■□□ 2
DHX38Q92620 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.56■■■□□ 2
DHX38Q92620 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DHX38Q92620 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
DHX38Q92620 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DHX38Q92620 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
DHX38Q92620 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.55■■■□□ 2
DHX38Q92620 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.55■■■□□ 2
DHX38Q92620 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
DHX38Q92620 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DHX38Q92620 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
DHX38Q92620 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DHX38Q92620 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DHX38Q92620 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DHX38Q92620 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.54■■■□□ 2
DHX38Q92620 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
DHX38Q92620 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
DHX38Q92620 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
DHX38Q92620 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DHX38Q92620 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
DHX38Q92620 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
DHX38Q92620 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DHX38Q92620 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DHX38Q92620 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
DHX38Q92620 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
DHX38Q92620 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
DHX38Q92620 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
DHX38Q92620 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
DHX38Q92620 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.52■■■□□ 2
DHX38Q92620 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
DHX38Q92620 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DHX38Q92620 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
DHX38Q92620 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
DHX38Q92620 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DHX38Q92620 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DHX38Q92620 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
DHX38Q92620 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
DHX38Q92620 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DHX38Q92620 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
DHX38Q92620 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.3 ms