Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXI8

CLEC4D, C-type lectin domain family 4 member D, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLEC4DQ8WXI8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CLEC4DQ8WXI8 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLEC4DQ8WXI8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
CLEC4DQ8WXI8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLEC4DQ8WXI8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CLEC4DQ8WXI8 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
CLEC4DQ8WXI8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLEC4DQ8WXI8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
CLEC4DQ8WXI8 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLEC4DQ8WXI8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLEC4DQ8WXI8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLEC4DQ8WXI8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLEC4DQ8WXI8 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLEC4DQ8WXI8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLEC4DQ8WXI8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLEC4DQ8WXI8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CLEC4DQ8WXI8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CLEC4DQ8WXI8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CLEC4DQ8WXI8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLEC4DQ8WXI8 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CLEC4DQ8WXI8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLEC4DQ8WXI8 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CLEC4DQ8WXI8 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CLEC4DQ8WXI8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLEC4DQ8WXI8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLEC4DQ8WXI8 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLEC4DQ8WXI8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLEC4DQ8WXI8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CLEC4DQ8WXI8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLEC4DQ8WXI8 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CLEC4DQ8WXI8 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CLEC4DQ8WXI8 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CLEC4DQ8WXI8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CLEC4DQ8WXI8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CLEC4DQ8WXI8 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLEC4DQ8WXI8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLEC4DQ8WXI8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
CLEC4DQ8WXI8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLEC4DQ8WXI8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CLEC4DQ8WXI8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLEC4DQ8WXI8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLEC4DQ8WXI8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CLEC4DQ8WXI8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLEC4DQ8WXI8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CLEC4DQ8WXI8 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLEC4DQ8WXI8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLEC4DQ8WXI8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLEC4DQ8WXI8 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CLEC4DQ8WXI8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLEC4DQ8WXI8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLEC4DQ8WXI8 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CLEC4DQ8WXI8 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLEC4DQ8WXI8 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CLEC4DQ8WXI8 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CLEC4DQ8WXI8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CLEC4DQ8WXI8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLEC4DQ8WXI8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLEC4DQ8WXI8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLEC4DQ8WXI8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLEC4DQ8WXI8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CLEC4DQ8WXI8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLEC4DQ8WXI8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLEC4DQ8WXI8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLEC4DQ8WXI8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLEC4DQ8WXI8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CLEC4DQ8WXI8 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLEC4DQ8WXI8 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLEC4DQ8WXI8 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLEC4DQ8WXI8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CLEC4DQ8WXI8 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLEC4DQ8WXI8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLEC4DQ8WXI8 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CLEC4DQ8WXI8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CLEC4DQ8WXI8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLEC4DQ8WXI8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLEC4DQ8WXI8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CLEC4DQ8WXI8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLEC4DQ8WXI8 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLEC4DQ8WXI8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLEC4DQ8WXI8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLEC4DQ8WXI8 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLEC4DQ8WXI8 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CLEC4DQ8WXI8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLEC4DQ8WXI8 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLEC4DQ8WXI8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLEC4DQ8WXI8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLEC4DQ8WXI8 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLEC4DQ8WXI8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CLEC4DQ8WXI8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLEC4DQ8WXI8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CLEC4DQ8WXI8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLEC4DQ8WXI8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLEC4DQ8WXI8 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLEC4DQ8WXI8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLEC4DQ8WXI8 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLEC4DQ8WXI8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CLEC4DQ8WXI8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CLEC4DQ8WXI8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLEC4DQ8WXI8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLEC4DQ8WXI8 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms