Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWT9

SLC13A3, Solute carrier family 13 member 3, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A3Q8WWT9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC13A3Q8WWT9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC13A3Q8WWT9 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC13A3Q8WWT9 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SLC13A3Q8WWT9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC13A3Q8WWT9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC13A3Q8WWT9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC13A3Q8WWT9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SLC13A3Q8WWT9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC13A3Q8WWT9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC13A3Q8WWT9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC13A3Q8WWT9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC13A3Q8WWT9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC13A3Q8WWT9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC13A3Q8WWT9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SLC13A3Q8WWT9 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC13A3Q8WWT9 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC13A3Q8WWT9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC13A3Q8WWT9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC13A3Q8WWT9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC13A3Q8WWT9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC13A3Q8WWT9 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SLC13A3Q8WWT9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC13A3Q8WWT9 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC13A3Q8WWT9 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC13A3Q8WWT9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC13A3Q8WWT9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC13A3Q8WWT9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC13A3Q8WWT9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC13A3Q8WWT9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC13A3Q8WWT9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC13A3Q8WWT9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC13A3Q8WWT9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC13A3Q8WWT9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC13A3Q8WWT9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC13A3Q8WWT9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC13A3Q8WWT9 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC13A3Q8WWT9 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC13A3Q8WWT9 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC13A3Q8WWT9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC13A3Q8WWT9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC13A3Q8WWT9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC13A3Q8WWT9 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC13A3Q8WWT9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC13A3Q8WWT9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC13A3Q8WWT9 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC13A3Q8WWT9 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC13A3Q8WWT9 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC13A3Q8WWT9 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC13A3Q8WWT9 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC13A3Q8WWT9 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC13A3Q8WWT9 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC13A3Q8WWT9 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC13A3Q8WWT9 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC13A3Q8WWT9 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC13A3Q8WWT9 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC13A3Q8WWT9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC13A3Q8WWT9 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC13A3Q8WWT9 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC13A3Q8WWT9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC13A3Q8WWT9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC13A3Q8WWT9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC13A3Q8WWT9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC13A3Q8WWT9 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC13A3Q8WWT9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC13A3Q8WWT9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC13A3Q8WWT9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC13A3Q8WWT9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC13A3Q8WWT9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC13A3Q8WWT9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC13A3Q8WWT9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC13A3Q8WWT9 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC13A3Q8WWT9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC13A3Q8WWT9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC13A3Q8WWT9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC13A3Q8WWT9 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC13A3Q8WWT9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC13A3Q8WWT9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC13A3Q8WWT9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC13A3Q8WWT9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC13A3Q8WWT9 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC13A3Q8WWT9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC13A3Q8WWT9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC13A3Q8WWT9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC13A3Q8WWT9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC13A3Q8WWT9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC13A3Q8WWT9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC13A3Q8WWT9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC13A3Q8WWT9 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC13A3Q8WWT9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC13A3Q8WWT9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC13A3Q8WWT9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC13A3Q8WWT9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC13A3Q8WWT9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC13A3Q8WWT9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC13A3Q8WWT9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC13A3Q8WWT9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC13A3Q8WWT9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC13A3Q8WWT9 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC13A3Q8WWT9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms