Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAF3

WDR48, WD repeat-containing protein 48, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR48Q8TAF3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WDR48Q8TAF3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR48Q8TAF3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR48Q8TAF3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR48Q8TAF3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR48Q8TAF3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR48Q8TAF3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
WDR48Q8TAF3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR48Q8TAF3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR48Q8TAF3 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
WDR48Q8TAF3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
WDR48Q8TAF3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
WDR48Q8TAF3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
WDR48Q8TAF3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR48Q8TAF3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR48Q8TAF3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR48Q8TAF3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR48Q8TAF3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR48Q8TAF3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
WDR48Q8TAF3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR48Q8TAF3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR48Q8TAF3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
WDR48Q8TAF3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR48Q8TAF3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR48Q8TAF3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR48Q8TAF3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR48Q8TAF3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR48Q8TAF3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR48Q8TAF3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR48Q8TAF3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR48Q8TAF3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
WDR48Q8TAF3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR48Q8TAF3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR48Q8TAF3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR48Q8TAF3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
WDR48Q8TAF3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR48Q8TAF3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR48Q8TAF3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR48Q8TAF3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR48Q8TAF3 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR48Q8TAF3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
WDR48Q8TAF3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR48Q8TAF3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR48Q8TAF3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR48Q8TAF3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR48Q8TAF3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR48Q8TAF3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
WDR48Q8TAF3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR48Q8TAF3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR48Q8TAF3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR48Q8TAF3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
WDR48Q8TAF3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR48Q8TAF3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR48Q8TAF3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR48Q8TAF3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR48Q8TAF3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
WDR48Q8TAF3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR48Q8TAF3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR48Q8TAF3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
WDR48Q8TAF3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR48Q8TAF3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR48Q8TAF3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR48Q8TAF3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR48Q8TAF3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR48Q8TAF3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR48Q8TAF3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
WDR48Q8TAF3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR48Q8TAF3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR48Q8TAF3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
WDR48Q8TAF3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR48Q8TAF3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR48Q8TAF3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
WDR48Q8TAF3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR48Q8TAF3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR48Q8TAF3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR48Q8TAF3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR48Q8TAF3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR48Q8TAF3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR48Q8TAF3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR48Q8TAF3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR48Q8TAF3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR48Q8TAF3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
WDR48Q8TAF3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR48Q8TAF3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR48Q8TAF3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR48Q8TAF3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR48Q8TAF3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR48Q8TAF3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR48Q8TAF3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
WDR48Q8TAF3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR48Q8TAF3 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR48Q8TAF3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR48Q8TAF3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR48Q8TAF3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR48Q8TAF3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
WDR48Q8TAF3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR48Q8TAF3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR48Q8TAF3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR48Q8TAF3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
WDR48Q8TAF3 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms