Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z392

TRAPPC11, Trafficking protein particle complex subunit 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC11Q7Z392 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TRAPPC11Q7Z392 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAPPC11Q7Z392 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAPPC11Q7Z392 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAPPC11Q7Z392 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAPPC11Q7Z392 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
TRAPPC11Q7Z392 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAPPC11Q7Z392 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAPPC11Q7Z392 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TRAPPC11Q7Z392 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAPPC11Q7Z392 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAPPC11Q7Z392 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAPPC11Q7Z392 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TRAPPC11Q7Z392 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAPPC11Q7Z392 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAPPC11Q7Z392 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
TRAPPC11Q7Z392 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TRAPPC11Q7Z392 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC11Q7Z392 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC11Q7Z392 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC11Q7Z392 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC11Q7Z392 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC11Q7Z392 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC11Q7Z392 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC11Q7Z392 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC11Q7Z392 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC11Q7Z392 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC11Q7Z392 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
TRAPPC11Q7Z392 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAPPC11Q7Z392 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAPPC11Q7Z392 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAPPC11Q7Z392 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TRAPPC11Q7Z392 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC11Q7Z392 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC11Q7Z392 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC11Q7Z392 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC11Q7Z392 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TRAPPC11Q7Z392 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC11Q7Z392 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC11Q7Z392 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TRAPPC11Q7Z392 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC11Q7Z392 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC11Q7Z392 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC11Q7Z392 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC11Q7Z392 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TRAPPC11Q7Z392 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.92
TRAPPC11Q7Z392 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC11Q7Z392 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC11Q7Z392 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC11Q7Z392 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TRAPPC11Q7Z392 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRAPPC11Q7Z392 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRAPPC11Q7Z392 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRAPPC11Q7Z392 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRAPPC11Q7Z392 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TRAPPC11Q7Z392 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TRAPPC11Q7Z392 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TRAPPC11Q7Z392 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TRAPPC11Q7Z392 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRAPPC11Q7Z392 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TRAPPC11Q7Z392 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC11Q7Z392 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC11Q7Z392 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC11Q7Z392 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC11Q7Z392 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC11Q7Z392 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TRAPPC11Q7Z392 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC11Q7Z392 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC11Q7Z392 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC11Q7Z392 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC11Q7Z392 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC11Q7Z392 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC11Q7Z392 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC11Q7Z392 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
TRAPPC11Q7Z392 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC11Q7Z392 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC11Q7Z392 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC11Q7Z392 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC11Q7Z392 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC11Q7Z392 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC11Q7Z392 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TRAPPC11Q7Z392 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC11Q7Z392 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC11Q7Z392 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC11Q7Z392 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC11Q7Z392 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TRAPPC11Q7Z392 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TRAPPC11Q7Z392 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TRAPPC11Q7Z392 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC11Q7Z392 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TRAPPC11Q7Z392 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC11Q7Z392 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC11Q7Z392 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC11Q7Z392 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC11Q7Z392 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TRAPPC11Q7Z392 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC11Q7Z392 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC11Q7Z392 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC11Q7Z392 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TRAPPC11Q7Z392 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms