Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT9

SLC29A4, Equilibrative nucleoside transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC29A4Q7RTT9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC29A4Q7RTT9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC29A4Q7RTT9 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC29A4Q7RTT9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC29A4Q7RTT9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC29A4Q7RTT9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC29A4Q7RTT9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC29A4Q7RTT9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC29A4Q7RTT9 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC29A4Q7RTT9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC29A4Q7RTT9 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC29A4Q7RTT9 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC29A4Q7RTT9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC29A4Q7RTT9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC29A4Q7RTT9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC29A4Q7RTT9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC29A4Q7RTT9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC29A4Q7RTT9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC29A4Q7RTT9 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC29A4Q7RTT9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SLC29A4Q7RTT9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC29A4Q7RTT9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC29A4Q7RTT9 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC29A4Q7RTT9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC29A4Q7RTT9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SLC29A4Q7RTT9 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC29A4Q7RTT9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC29A4Q7RTT9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC29A4Q7RTT9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC29A4Q7RTT9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC29A4Q7RTT9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC29A4Q7RTT9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SLC29A4Q7RTT9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC29A4Q7RTT9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC29A4Q7RTT9 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC29A4Q7RTT9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SLC29A4Q7RTT9 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC29A4Q7RTT9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC29A4Q7RTT9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SLC29A4Q7RTT9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC29A4Q7RTT9 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC29A4Q7RTT9 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC29A4Q7RTT9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SLC29A4Q7RTT9 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC29A4Q7RTT9 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC29A4Q7RTT9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC29A4Q7RTT9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC29A4Q7RTT9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SLC29A4Q7RTT9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC29A4Q7RTT9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SLC29A4Q7RTT9 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC29A4Q7RTT9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC29A4Q7RTT9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC29A4Q7RTT9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC29A4Q7RTT9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC29A4Q7RTT9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
SLC29A4Q7RTT9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC29A4Q7RTT9 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC29A4Q7RTT9 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC29A4Q7RTT9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC29A4Q7RTT9 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
SLC29A4Q7RTT9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC29A4Q7RTT9 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC29A4Q7RTT9 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
SLC29A4Q7RTT9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC29A4Q7RTT9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC29A4Q7RTT9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC29A4Q7RTT9 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SLC29A4Q7RTT9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC29A4Q7RTT9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC29A4Q7RTT9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
SLC29A4Q7RTT9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC29A4Q7RTT9 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC29A4Q7RTT9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC29A4Q7RTT9 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC29A4Q7RTT9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC29A4Q7RTT9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SLC29A4Q7RTT9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC29A4Q7RTT9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC29A4Q7RTT9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC29A4Q7RTT9 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
SLC29A4Q7RTT9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC29A4Q7RTT9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC29A4Q7RTT9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC29A4Q7RTT9 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC29A4Q7RTT9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SLC29A4Q7RTT9 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC29A4Q7RTT9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC29A4Q7RTT9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC29A4Q7RTT9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC29A4Q7RTT9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC29A4Q7RTT9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SLC29A4Q7RTT9 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLC29A4Q7RTT9 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC29A4Q7RTT9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLC29A4Q7RTT9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC29A4Q7RTT9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC29A4Q7RTT9 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC29A4Q7RTT9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLC29A4Q7RTT9 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms