Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CAPN12Q6ZSI9 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN12Q6ZSI9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN12Q6ZSI9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CAPN12Q6ZSI9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN12Q6ZSI9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN12Q6ZSI9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN12Q6ZSI9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN12Q6ZSI9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CAPN12Q6ZSI9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPN12Q6ZSI9 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPN12Q6ZSI9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPN12Q6ZSI9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CAPN12Q6ZSI9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN12Q6ZSI9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN12Q6ZSI9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CAPN12Q6ZSI9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN12Q6ZSI9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN12Q6ZSI9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN12Q6ZSI9 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN12Q6ZSI9 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN12Q6ZSI9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN12Q6ZSI9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CAPN12Q6ZSI9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN12Q6ZSI9 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN12Q6ZSI9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN12Q6ZSI9 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CAPN12Q6ZSI9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN12Q6ZSI9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN12Q6ZSI9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN12Q6ZSI9 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN12Q6ZSI9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN12Q6ZSI9 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN12Q6ZSI9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CAPN12Q6ZSI9 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN12Q6ZSI9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN12Q6ZSI9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN12Q6ZSI9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN12Q6ZSI9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN12Q6ZSI9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN12Q6ZSI9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CAPN12Q6ZSI9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN12Q6ZSI9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CAPN12Q6ZSI9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN12Q6ZSI9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN12Q6ZSI9 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN12Q6ZSI9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN12Q6ZSI9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN12Q6ZSI9 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN12Q6ZSI9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN12Q6ZSI9 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN12Q6ZSI9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CAPN12Q6ZSI9 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN12Q6ZSI9 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN12Q6ZSI9 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN12Q6ZSI9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN12Q6ZSI9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN12Q6ZSI9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN12Q6ZSI9 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CAPN12Q6ZSI9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN12Q6ZSI9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN12Q6ZSI9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN12Q6ZSI9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN12Q6ZSI9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN12Q6ZSI9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN12Q6ZSI9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CAPN12Q6ZSI9 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN12Q6ZSI9 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN12Q6ZSI9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN12Q6ZSI9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN12Q6ZSI9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN12Q6ZSI9 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN12Q6ZSI9 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN12Q6ZSI9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CAPN12Q6ZSI9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN12Q6ZSI9 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN12Q6ZSI9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN12Q6ZSI9 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CAPN12Q6ZSI9 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN12Q6ZSI9 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN12Q6ZSI9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN12Q6ZSI9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN12Q6ZSI9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN12Q6ZSI9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN12Q6ZSI9 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CAPN12Q6ZSI9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
CAPN12Q6ZSI9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN12Q6ZSI9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN12Q6ZSI9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CAPN12Q6ZSI9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN12Q6ZSI9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN12Q6ZSI9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN12Q6ZSI9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN12Q6ZSI9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CAPN12Q6ZSI9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN12Q6ZSI9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN12Q6ZSI9 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN12Q6ZSI9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN12Q6ZSI9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CAPN12Q6ZSI9 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms