Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CCDC141Q6ZP82 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
CCDC141Q6ZP82 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC37.71■■■■□ 3.63
CCDC141Q6ZP82 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC37.69■■■■□ 3.62
CCDC141Q6ZP82 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CCDC141Q6ZP82 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CCDC141Q6ZP82 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
CCDC141Q6ZP82 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.67■■■■□ 3.62
CCDC141Q6ZP82 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
CCDC141Q6ZP82 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC37.66■■■■□ 3.62
CCDC141Q6ZP82 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC37.65■■■■□ 3.62
CCDC141Q6ZP82 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
CCDC141Q6ZP82 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
CCDC141Q6ZP82 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
CCDC141Q6ZP82 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
CCDC141Q6ZP82 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
CCDC141Q6ZP82 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.62
CCDC141Q6ZP82 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
CCDC141Q6ZP82 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC37.63■■■■□ 3.61
CCDC141Q6ZP82 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
CCDC141Q6ZP82 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC37.62■■■■□ 3.61
CCDC141Q6ZP82 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
CCDC141Q6ZP82 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CCDC141Q6ZP82 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CCDC141Q6ZP82 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
CCDC141Q6ZP82 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
CCDC141Q6ZP82 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
CCDC141Q6ZP82 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
CCDC141Q6ZP82 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
CCDC141Q6ZP82 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
CCDC141Q6ZP82 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.59■■■■□ 3.61
CCDC141Q6ZP82 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
CCDC141Q6ZP82 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
CCDC141Q6ZP82 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
CCDC141Q6ZP82 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
CCDC141Q6ZP82 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.61
CCDC141Q6ZP82 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
CCDC141Q6ZP82 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
CCDC141Q6ZP82 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
CCDC141Q6ZP82 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC37.55■■■■□ 3.6
CCDC141Q6ZP82 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
CCDC141Q6ZP82 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CCDC141Q6ZP82 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
CCDC141Q6ZP82 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CCDC141Q6ZP82 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC37.52■■■■□ 3.6
CCDC141Q6ZP82 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
CCDC141Q6ZP82 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
CCDC141Q6ZP82 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
CCDC141Q6ZP82 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
CCDC141Q6ZP82 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.59
CCDC141Q6ZP82 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.59
CCDC141Q6ZP82 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC37.51■■■■□ 3.59
CCDC141Q6ZP82 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
CCDC141Q6ZP82 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
CCDC141Q6ZP82 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC37.5■■■■□ 3.59
CCDC141Q6ZP82 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CCDC141Q6ZP82 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
CCDC141Q6ZP82 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC37.49■■■■□ 3.59
CCDC141Q6ZP82 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CCDC141Q6ZP82 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
CCDC141Q6ZP82 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
CCDC141Q6ZP82 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CCDC141Q6ZP82 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
CCDC141Q6ZP82 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
CCDC141Q6ZP82 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC37.48■■■■□ 3.59
CCDC141Q6ZP82 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
CCDC141Q6ZP82 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CCDC141Q6ZP82 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.47■■■■□ 3.59
CCDC141Q6ZP82 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CCDC141Q6ZP82 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
CCDC141Q6ZP82 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
CCDC141Q6ZP82 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
CCDC141Q6ZP82 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
CCDC141Q6ZP82 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
CCDC141Q6ZP82 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
CCDC141Q6ZP82 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
CCDC141Q6ZP82 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC37.45■■■■□ 3.59
CCDC141Q6ZP82 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
CCDC141Q6ZP82 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC37.44■■■■□ 3.58
CCDC141Q6ZP82 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
CCDC141Q6ZP82 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
CCDC141Q6ZP82 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.43■■■■□ 3.58
CCDC141Q6ZP82 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
CCDC141Q6ZP82 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.42■■■■□ 3.58
CCDC141Q6ZP82 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CCDC141Q6ZP82 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CCDC141Q6ZP82 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
CCDC141Q6ZP82 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CCDC141Q6ZP82 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CCDC141Q6ZP82 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CCDC141Q6ZP82 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CCDC141Q6ZP82 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC37.41■■■■□ 3.58
CCDC141Q6ZP82 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CCDC141Q6ZP82 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
CCDC141Q6ZP82 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CCDC141Q6ZP82 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CCDC141Q6ZP82 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
CCDC141Q6ZP82 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
CCDC141Q6ZP82 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC37.4■■■■□ 3.58
CCDC141Q6ZP82 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC37.39■■■■□ 3.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms