Protein–RNA interactions for Protein: Q6YI46

TMEM64, Transmembrane protein 64, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM64Q6YI46 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM64Q6YI46 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM64Q6YI46 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM64Q6YI46 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM64Q6YI46 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM64Q6YI46 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM64Q6YI46 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM64Q6YI46 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM64Q6YI46 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM64Q6YI46 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM64Q6YI46 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM64Q6YI46 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM64Q6YI46 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM64Q6YI46 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM64Q6YI46 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM64Q6YI46 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM64Q6YI46 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM64Q6YI46 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM64Q6YI46 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM64Q6YI46 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM64Q6YI46 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM64Q6YI46 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM64Q6YI46 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM64Q6YI46 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM64Q6YI46 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM64Q6YI46 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM64Q6YI46 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM64Q6YI46 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM64Q6YI46 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM64Q6YI46 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM64Q6YI46 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM64Q6YI46 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM64Q6YI46 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM64Q6YI46 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM64Q6YI46 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM64Q6YI46 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM64Q6YI46 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM64Q6YI46 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM64Q6YI46 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM64Q6YI46 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM64Q6YI46 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM64Q6YI46 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM64Q6YI46 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM64Q6YI46 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM64Q6YI46 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM64Q6YI46 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM64Q6YI46 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM64Q6YI46 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM64Q6YI46 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM64Q6YI46 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM64Q6YI46 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM64Q6YI46 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM64Q6YI46 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM64Q6YI46 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM64Q6YI46 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM64Q6YI46 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM64Q6YI46 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM64Q6YI46 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM64Q6YI46 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM64Q6YI46 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM64Q6YI46 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM64Q6YI46 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM64Q6YI46 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM64Q6YI46 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM64Q6YI46 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM64Q6YI46 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM64Q6YI46 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM64Q6YI46 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM64Q6YI46 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM64Q6YI46 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM64Q6YI46 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM64Q6YI46 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM64Q6YI46 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM64Q6YI46 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM64Q6YI46 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM64Q6YI46 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM64Q6YI46 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMEM64Q6YI46 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM64Q6YI46 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM64Q6YI46 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM64Q6YI46 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMEM64Q6YI46 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM64Q6YI46 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM64Q6YI46 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM64Q6YI46 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM64Q6YI46 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM64Q6YI46 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMEM64Q6YI46 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM64Q6YI46 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM64Q6YI46 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TMEM64Q6YI46 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM64Q6YI46 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM64Q6YI46 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM64Q6YI46 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TMEM64Q6YI46 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM64Q6YI46 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM64Q6YI46 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM64Q6YI46 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM64Q6YI46 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TMEM64Q6YI46 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms