Protein–RNA interactions for Protein: Q6X4U4

SOSTDC1, Sclerostin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOSTDC1Q6X4U4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SOSTDC1Q6X4U4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SOSTDC1Q6X4U4 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SOSTDC1Q6X4U4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SOSTDC1Q6X4U4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOSTDC1Q6X4U4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOSTDC1Q6X4U4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOSTDC1Q6X4U4 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOSTDC1Q6X4U4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SOSTDC1Q6X4U4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOSTDC1Q6X4U4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOSTDC1Q6X4U4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOSTDC1Q6X4U4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOSTDC1Q6X4U4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOSTDC1Q6X4U4 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOSTDC1Q6X4U4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOSTDC1Q6X4U4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SOSTDC1Q6X4U4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOSTDC1Q6X4U4 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOSTDC1Q6X4U4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOSTDC1Q6X4U4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOSTDC1Q6X4U4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOSTDC1Q6X4U4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SOSTDC1Q6X4U4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOSTDC1Q6X4U4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOSTDC1Q6X4U4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOSTDC1Q6X4U4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOSTDC1Q6X4U4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOSTDC1Q6X4U4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOSTDC1Q6X4U4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOSTDC1Q6X4U4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SOSTDC1Q6X4U4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOSTDC1Q6X4U4 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SOSTDC1Q6X4U4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOSTDC1Q6X4U4 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOSTDC1Q6X4U4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOSTDC1Q6X4U4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SOSTDC1Q6X4U4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
SOSTDC1Q6X4U4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOSTDC1Q6X4U4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOSTDC1Q6X4U4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOSTDC1Q6X4U4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOSTDC1Q6X4U4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
SOSTDC1Q6X4U4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOSTDC1Q6X4U4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOSTDC1Q6X4U4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOSTDC1Q6X4U4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SOSTDC1Q6X4U4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SOSTDC1Q6X4U4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SOSTDC1Q6X4U4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SOSTDC1Q6X4U4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SOSTDC1Q6X4U4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SOSTDC1Q6X4U4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOSTDC1Q6X4U4 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOSTDC1Q6X4U4 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOSTDC1Q6X4U4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOSTDC1Q6X4U4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOSTDC1Q6X4U4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOSTDC1Q6X4U4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOSTDC1Q6X4U4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOSTDC1Q6X4U4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOSTDC1Q6X4U4 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOSTDC1Q6X4U4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOSTDC1Q6X4U4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOSTDC1Q6X4U4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOSTDC1Q6X4U4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOSTDC1Q6X4U4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOSTDC1Q6X4U4 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SOSTDC1Q6X4U4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOSTDC1Q6X4U4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOSTDC1Q6X4U4 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOSTDC1Q6X4U4 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOSTDC1Q6X4U4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SOSTDC1Q6X4U4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOSTDC1Q6X4U4 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOSTDC1Q6X4U4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SOSTDC1Q6X4U4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SOSTDC1Q6X4U4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOSTDC1Q6X4U4 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOSTDC1Q6X4U4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOSTDC1Q6X4U4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOSTDC1Q6X4U4 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOSTDC1Q6X4U4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOSTDC1Q6X4U4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOSTDC1Q6X4U4 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOSTDC1Q6X4U4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOSTDC1Q6X4U4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOSTDC1Q6X4U4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOSTDC1Q6X4U4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SOSTDC1Q6X4U4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SOSTDC1Q6X4U4 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOSTDC1Q6X4U4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOSTDC1Q6X4U4 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOSTDC1Q6X4U4 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOSTDC1Q6X4U4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOSTDC1Q6X4U4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOSTDC1Q6X4U4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOSTDC1Q6X4U4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOSTDC1Q6X4U4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SOSTDC1Q6X4U4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms