Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXC1

MAMDC4, Apical endosomal glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAMDC4Q6UXC1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MAMDC4Q6UXC1 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MAMDC4Q6UXC1 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MAMDC4Q6UXC1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MAMDC4Q6UXC1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MAMDC4Q6UXC1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MAMDC4Q6UXC1 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MAMDC4Q6UXC1 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAMDC4Q6UXC1 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAMDC4Q6UXC1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAMDC4Q6UXC1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MAMDC4Q6UXC1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MAMDC4Q6UXC1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MAMDC4Q6UXC1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MAMDC4Q6UXC1 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MAMDC4Q6UXC1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MAMDC4Q6UXC1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
MAMDC4Q6UXC1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MAMDC4Q6UXC1 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MAMDC4Q6UXC1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MAMDC4Q6UXC1 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MAMDC4Q6UXC1 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MAMDC4Q6UXC1 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MAMDC4Q6UXC1 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MAMDC4Q6UXC1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
MAMDC4Q6UXC1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MAMDC4Q6UXC1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MAMDC4Q6UXC1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MAMDC4Q6UXC1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MAMDC4Q6UXC1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MAMDC4Q6UXC1 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MAMDC4Q6UXC1 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MAMDC4Q6UXC1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MAMDC4Q6UXC1 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MAMDC4Q6UXC1 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
MAMDC4Q6UXC1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MAMDC4Q6UXC1 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MAMDC4Q6UXC1 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
MAMDC4Q6UXC1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
MAMDC4Q6UXC1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
MAMDC4Q6UXC1 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
MAMDC4Q6UXC1 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MAMDC4Q6UXC1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MAMDC4Q6UXC1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
MAMDC4Q6UXC1 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MAMDC4Q6UXC1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MAMDC4Q6UXC1 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MAMDC4Q6UXC1 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MAMDC4Q6UXC1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MAMDC4Q6UXC1 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MAMDC4Q6UXC1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
MAMDC4Q6UXC1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MAMDC4Q6UXC1 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
MAMDC4Q6UXC1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MAMDC4Q6UXC1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MAMDC4Q6UXC1 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MAMDC4Q6UXC1 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
MAMDC4Q6UXC1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
MAMDC4Q6UXC1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MAMDC4Q6UXC1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MAMDC4Q6UXC1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MAMDC4Q6UXC1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MAMDC4Q6UXC1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MAMDC4Q6UXC1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MAMDC4Q6UXC1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MAMDC4Q6UXC1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MAMDC4Q6UXC1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MAMDC4Q6UXC1 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MAMDC4Q6UXC1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MAMDC4Q6UXC1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MAMDC4Q6UXC1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MAMDC4Q6UXC1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MAMDC4Q6UXC1 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MAMDC4Q6UXC1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MAMDC4Q6UXC1 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MAMDC4Q6UXC1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MAMDC4Q6UXC1 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MAMDC4Q6UXC1 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MAMDC4Q6UXC1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
MAMDC4Q6UXC1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MAMDC4Q6UXC1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MAMDC4Q6UXC1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MAMDC4Q6UXC1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MAMDC4Q6UXC1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MAMDC4Q6UXC1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MAMDC4Q6UXC1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MAMDC4Q6UXC1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MAMDC4Q6UXC1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MAMDC4Q6UXC1 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MAMDC4Q6UXC1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MAMDC4Q6UXC1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MAMDC4Q6UXC1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MAMDC4Q6UXC1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MAMDC4Q6UXC1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
MAMDC4Q6UXC1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
MAMDC4Q6UXC1 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28■■■□□ 2.07
MAMDC4Q6UXC1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28■■■□□ 2.07
MAMDC4Q6UXC1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MAMDC4Q6UXC1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MAMDC4Q6UXC1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms