Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q6R5

CRIP3, Cysteine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP3Q6Q6R5 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CRIP3Q6Q6R5 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRIP3Q6Q6R5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRIP3Q6Q6R5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRIP3Q6Q6R5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRIP3Q6Q6R5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRIP3Q6Q6R5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CRIP3Q6Q6R5 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRIP3Q6Q6R5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRIP3Q6Q6R5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRIP3Q6Q6R5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRIP3Q6Q6R5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRIP3Q6Q6R5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRIP3Q6Q6R5 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRIP3Q6Q6R5 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRIP3Q6Q6R5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRIP3Q6Q6R5 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CRIP3Q6Q6R5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRIP3Q6Q6R5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRIP3Q6Q6R5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRIP3Q6Q6R5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRIP3Q6Q6R5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRIP3Q6Q6R5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRIP3Q6Q6R5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRIP3Q6Q6R5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CRIP3Q6Q6R5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRIP3Q6Q6R5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CRIP3Q6Q6R5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRIP3Q6Q6R5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRIP3Q6Q6R5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CRIP3Q6Q6R5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRIP3Q6Q6R5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRIP3Q6Q6R5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRIP3Q6Q6R5 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRIP3Q6Q6R5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRIP3Q6Q6R5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRIP3Q6Q6R5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRIP3Q6Q6R5 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRIP3Q6Q6R5 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRIP3Q6Q6R5 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CRIP3Q6Q6R5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRIP3Q6Q6R5 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRIP3Q6Q6R5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRIP3Q6Q6R5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CRIP3Q6Q6R5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CRIP3Q6Q6R5 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRIP3Q6Q6R5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRIP3Q6Q6R5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRIP3Q6Q6R5 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRIP3Q6Q6R5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRIP3Q6Q6R5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRIP3Q6Q6R5 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRIP3Q6Q6R5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRIP3Q6Q6R5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CRIP3Q6Q6R5 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRIP3Q6Q6R5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRIP3Q6Q6R5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CRIP3Q6Q6R5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRIP3Q6Q6R5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRIP3Q6Q6R5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRIP3Q6Q6R5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CRIP3Q6Q6R5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRIP3Q6Q6R5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRIP3Q6Q6R5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRIP3Q6Q6R5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRIP3Q6Q6R5 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRIP3Q6Q6R5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRIP3Q6Q6R5 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRIP3Q6Q6R5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRIP3Q6Q6R5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRIP3Q6Q6R5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRIP3Q6Q6R5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRIP3Q6Q6R5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRIP3Q6Q6R5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRIP3Q6Q6R5 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CRIP3Q6Q6R5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRIP3Q6Q6R5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRIP3Q6Q6R5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRIP3Q6Q6R5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRIP3Q6Q6R5 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRIP3Q6Q6R5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CRIP3Q6Q6R5 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRIP3Q6Q6R5 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRIP3Q6Q6R5 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CRIP3Q6Q6R5 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CRIP3Q6Q6R5 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CRIP3Q6Q6R5 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CRIP3Q6Q6R5 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CRIP3Q6Q6R5 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CRIP3Q6Q6R5 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CRIP3Q6Q6R5 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CRIP3Q6Q6R5 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
CRIP3Q6Q6R5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRIP3Q6Q6R5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CRIP3Q6Q6R5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRIP3Q6Q6R5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRIP3Q6Q6R5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CRIP3Q6Q6R5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRIP3Q6Q6R5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CRIP3Q6Q6R5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms