Protein–RNA interactions for Protein: Q6P597

KLC3, Kinesin light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLC3Q6P597 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KLC3Q6P597 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLC3Q6P597 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLC3Q6P597 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLC3Q6P597 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLC3Q6P597 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLC3Q6P597 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
KLC3Q6P597 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
KLC3Q6P597 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLC3Q6P597 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLC3Q6P597 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLC3Q6P597 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLC3Q6P597 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
KLC3Q6P597 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLC3Q6P597 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
KLC3Q6P597 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
KLC3Q6P597 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLC3Q6P597 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLC3Q6P597 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
KLC3Q6P597 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLC3Q6P597 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLC3Q6P597 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
KLC3Q6P597 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLC3Q6P597 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLC3Q6P597 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLC3Q6P597 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
KLC3Q6P597 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
KLC3Q6P597 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLC3Q6P597 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLC3Q6P597 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLC3Q6P597 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
KLC3Q6P597 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
KLC3Q6P597 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLC3Q6P597 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLC3Q6P597 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLC3Q6P597 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
KLC3Q6P597 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
KLC3Q6P597 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLC3Q6P597 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLC3Q6P597 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLC3Q6P597 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
KLC3Q6P597 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLC3Q6P597 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLC3Q6P597 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLC3Q6P597 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
KLC3Q6P597 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLC3Q6P597 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLC3Q6P597 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
KLC3Q6P597 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLC3Q6P597 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
KLC3Q6P597 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
KLC3Q6P597 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLC3Q6P597 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
KLC3Q6P597 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLC3Q6P597 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLC3Q6P597 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLC3Q6P597 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLC3Q6P597 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLC3Q6P597 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
KLC3Q6P597 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLC3Q6P597 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLC3Q6P597 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLC3Q6P597 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLC3Q6P597 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLC3Q6P597 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLC3Q6P597 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
KLC3Q6P597 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLC3Q6P597 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLC3Q6P597 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLC3Q6P597 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLC3Q6P597 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLC3Q6P597 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
KLC3Q6P597 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
KLC3Q6P597 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms