Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A4Q6P1M0 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A4Q6P1M0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A4Q6P1M0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC27A4Q6P1M0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A4Q6P1M0 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A4Q6P1M0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A4Q6P1M0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A4Q6P1M0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC27A4Q6P1M0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A4Q6P1M0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A4Q6P1M0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A4Q6P1M0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A4Q6P1M0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A4Q6P1M0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A4Q6P1M0 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A4Q6P1M0 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC27A4Q6P1M0 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A4Q6P1M0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A4Q6P1M0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC27A4Q6P1M0 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A4Q6P1M0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A4Q6P1M0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A4Q6P1M0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A4Q6P1M0 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A4Q6P1M0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC27A4Q6P1M0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A4Q6P1M0 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A4Q6P1M0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A4Q6P1M0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A4Q6P1M0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A4Q6P1M0 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A4Q6P1M0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC27A4Q6P1M0 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A4Q6P1M0 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A4Q6P1M0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A4Q6P1M0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC27A4Q6P1M0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC27A4Q6P1M0 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A4Q6P1M0 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A4Q6P1M0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A4Q6P1M0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC27A4Q6P1M0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A4Q6P1M0 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A4Q6P1M0 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A4Q6P1M0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A4Q6P1M0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A4Q6P1M0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A4Q6P1M0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC27A4Q6P1M0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A4Q6P1M0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A4Q6P1M0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A4Q6P1M0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SLC27A4Q6P1M0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A4Q6P1M0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A4Q6P1M0 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A4Q6P1M0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A4Q6P1M0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A4Q6P1M0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A4Q6P1M0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SLC27A4Q6P1M0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A4Q6P1M0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A4Q6P1M0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A4Q6P1M0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A4Q6P1M0 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SLC27A4Q6P1M0 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A4Q6P1M0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A4Q6P1M0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A4Q6P1M0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A4Q6P1M0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A4Q6P1M0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SLC27A4Q6P1M0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
SLC27A4Q6P1M0 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A4Q6P1M0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A4Q6P1M0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A4Q6P1M0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A4Q6P1M0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A4Q6P1M0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A4Q6P1M0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A4Q6P1M0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A4Q6P1M0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SLC27A4Q6P1M0 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A4Q6P1M0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A4Q6P1M0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A4Q6P1M0 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A4Q6P1M0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SLC27A4Q6P1M0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC27A4Q6P1M0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SLC27A4Q6P1M0 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A4Q6P1M0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A4Q6P1M0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A4Q6P1M0 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A4Q6P1M0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A4Q6P1M0 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A4Q6P1M0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A4Q6P1M0 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A4Q6P1M0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
SLC27A4Q6P1M0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A4Q6P1M0 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SLC27A4Q6P1M0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 152.6 ms