Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1K2

PMF1, Polyamine-modulated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMF1Q6P1K2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PMF1Q6P1K2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PMF1Q6P1K2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PMF1Q6P1K2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PMF1Q6P1K2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PMF1Q6P1K2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PMF1Q6P1K2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PMF1Q6P1K2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PMF1Q6P1K2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PMF1Q6P1K2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PMF1Q6P1K2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PMF1Q6P1K2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PMF1Q6P1K2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PMF1Q6P1K2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PMF1Q6P1K2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PMF1Q6P1K2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PMF1Q6P1K2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PMF1Q6P1K2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PMF1Q6P1K2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PMF1Q6P1K2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PMF1Q6P1K2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PMF1Q6P1K2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PMF1Q6P1K2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
PMF1Q6P1K2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PMF1Q6P1K2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PMF1Q6P1K2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PMF1Q6P1K2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PMF1Q6P1K2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PMF1Q6P1K2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PMF1Q6P1K2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PMF1Q6P1K2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PMF1Q6P1K2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PMF1Q6P1K2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PMF1Q6P1K2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PMF1Q6P1K2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PMF1Q6P1K2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PMF1Q6P1K2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PMF1Q6P1K2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PMF1Q6P1K2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PMF1Q6P1K2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PMF1Q6P1K2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PMF1Q6P1K2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PMF1Q6P1K2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PMF1Q6P1K2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PMF1Q6P1K2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PMF1Q6P1K2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PMF1Q6P1K2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PMF1Q6P1K2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PMF1Q6P1K2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PMF1Q6P1K2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PMF1Q6P1K2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PMF1Q6P1K2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PMF1Q6P1K2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PMF1Q6P1K2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PMF1Q6P1K2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PMF1Q6P1K2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PMF1Q6P1K2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PMF1Q6P1K2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PMF1Q6P1K2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PMF1Q6P1K2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PMF1Q6P1K2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PMF1Q6P1K2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PMF1Q6P1K2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PMF1Q6P1K2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PMF1Q6P1K2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PMF1Q6P1K2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PMF1Q6P1K2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PMF1Q6P1K2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PMF1Q6P1K2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PMF1Q6P1K2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PMF1Q6P1K2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PMF1Q6P1K2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PMF1Q6P1K2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PMF1Q6P1K2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PMF1Q6P1K2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PMF1Q6P1K2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PMF1Q6P1K2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PMF1Q6P1K2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
PMF1Q6P1K2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PMF1Q6P1K2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PMF1Q6P1K2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PMF1Q6P1K2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PMF1Q6P1K2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PMF1Q6P1K2 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PMF1Q6P1K2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PMF1Q6P1K2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PMF1Q6P1K2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PMF1Q6P1K2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PMF1Q6P1K2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PMF1Q6P1K2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PMF1Q6P1K2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PMF1Q6P1K2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PMF1Q6P1K2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PMF1Q6P1K2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PMF1Q6P1K2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PMF1Q6P1K2 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PMF1Q6P1K2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PMF1Q6P1K2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PMF1Q6P1K2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PMF1Q6P1K2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms