Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVV1

RPL13AP3, Putative 60S ribosomal protein L13a protein RPL13AP3, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL13AP3Q6NVV1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL13AP3Q6NVV1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL13AP3Q6NVV1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL13AP3Q6NVV1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RPL13AP3Q6NVV1 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL13AP3Q6NVV1 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL13AP3Q6NVV1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL13AP3Q6NVV1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL13AP3Q6NVV1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL13AP3Q6NVV1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
RPL13AP3Q6NVV1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL13AP3Q6NVV1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL13AP3Q6NVV1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL13AP3Q6NVV1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
RPL13AP3Q6NVV1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL13AP3Q6NVV1 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL13AP3Q6NVV1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL13AP3Q6NVV1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL13AP3Q6NVV1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL13AP3Q6NVV1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
RPL13AP3Q6NVV1 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL13AP3Q6NVV1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL13AP3Q6NVV1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL13AP3Q6NVV1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL13AP3Q6NVV1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL13AP3Q6NVV1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL13AP3Q6NVV1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL13AP3Q6NVV1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
RPL13AP3Q6NVV1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL13AP3Q6NVV1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL13AP3Q6NVV1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL13AP3Q6NVV1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL13AP3Q6NVV1 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL13AP3Q6NVV1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL13AP3Q6NVV1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
RPL13AP3Q6NVV1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL13AP3Q6NVV1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL13AP3Q6NVV1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL13AP3Q6NVV1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
RPL13AP3Q6NVV1 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL13AP3Q6NVV1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
RPL13AP3Q6NVV1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL13AP3Q6NVV1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL13AP3Q6NVV1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL13AP3Q6NVV1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL13AP3Q6NVV1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL13AP3Q6NVV1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL13AP3Q6NVV1 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
RPL13AP3Q6NVV1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL13AP3Q6NVV1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL13AP3Q6NVV1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL13AP3Q6NVV1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL13AP3Q6NVV1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
RPL13AP3Q6NVV1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL13AP3Q6NVV1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL13AP3Q6NVV1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL13AP3Q6NVV1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL13AP3Q6NVV1 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL13AP3Q6NVV1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
RPL13AP3Q6NVV1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL13AP3Q6NVV1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL13AP3Q6NVV1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL13AP3Q6NVV1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL13AP3Q6NVV1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL13AP3Q6NVV1 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL13AP3Q6NVV1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL13AP3Q6NVV1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL13AP3Q6NVV1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL13AP3Q6NVV1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
RPL13AP3Q6NVV1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL13AP3Q6NVV1 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL13AP3Q6NVV1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL13AP3Q6NVV1 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
RPL13AP3Q6NVV1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL13AP3Q6NVV1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL13AP3Q6NVV1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL13AP3Q6NVV1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
RPL13AP3Q6NVV1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL13AP3Q6NVV1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
RPL13AP3Q6NVV1 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
RPL13AP3Q6NVV1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL13AP3Q6NVV1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL13AP3Q6NVV1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL13AP3Q6NVV1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL13AP3Q6NVV1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL13AP3Q6NVV1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL13AP3Q6NVV1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL13AP3Q6NVV1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL13AP3Q6NVV1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL13AP3Q6NVV1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
RPL13AP3Q6NVV1 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL13AP3Q6NVV1 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL13AP3Q6NVV1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL13AP3Q6NVV1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL13AP3Q6NVV1 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL13AP3Q6NVV1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL13AP3Q6NVV1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
RPL13AP3Q6NVV1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL13AP3Q6NVV1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RPL13AP3Q6NVV1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms