Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
REEP3Q6NUK4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
REEP3Q6NUK4 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
REEP3Q6NUK4 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
REEP3Q6NUK4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
REEP3Q6NUK4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
REEP3Q6NUK4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
REEP3Q6NUK4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
REEP3Q6NUK4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
REEP3Q6NUK4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
REEP3Q6NUK4 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
REEP3Q6NUK4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
REEP3Q6NUK4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
REEP3Q6NUK4 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
REEP3Q6NUK4 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
REEP3Q6NUK4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
REEP3Q6NUK4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
REEP3Q6NUK4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
REEP3Q6NUK4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
REEP3Q6NUK4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
REEP3Q6NUK4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
REEP3Q6NUK4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
REEP3Q6NUK4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
REEP3Q6NUK4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
REEP3Q6NUK4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
REEP3Q6NUK4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
REEP3Q6NUK4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
REEP3Q6NUK4 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
REEP3Q6NUK4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
REEP3Q6NUK4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
REEP3Q6NUK4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
REEP3Q6NUK4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
REEP3Q6NUK4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
REEP3Q6NUK4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
REEP3Q6NUK4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
REEP3Q6NUK4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
REEP3Q6NUK4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
REEP3Q6NUK4 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
REEP3Q6NUK4 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
REEP3Q6NUK4 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
REEP3Q6NUK4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
REEP3Q6NUK4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
REEP3Q6NUK4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
REEP3Q6NUK4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
REEP3Q6NUK4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
REEP3Q6NUK4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
REEP3Q6NUK4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
REEP3Q6NUK4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
REEP3Q6NUK4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
REEP3Q6NUK4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
REEP3Q6NUK4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
REEP3Q6NUK4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
REEP3Q6NUK4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
REEP3Q6NUK4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
REEP3Q6NUK4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms